More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0837 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 		 359 aa  729    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  65.35 
 
 		 337 aa  427  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.33 
 
 		 334 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  61.28 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  63.25 
 
 		 333 aa  385  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  62.35 
 
 		 332 aa  382  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  60.36 
 
 		 333 aa  381  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  61.21 
 
 		 335 aa  379  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  62.09 
 
 		 337 aa  378  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.23 
 
 		 340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  52.4 
 
 		 334 aa  325  9e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  51.07 
 
 		 337 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  49.7 
 
 		 327 aa  301  9e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  50.76 
 
 		 337 aa  299  6e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 326 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  48.94 
 
 		 338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  48.51 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  48.01 
 
 		 329 aa  278  9e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  48.01 
 
 		 329 aa  278  9e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  49.24 
 
 		 338 aa  278  1e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  46.81 
 
 		 338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2285  GTPase ObgE  47.37 
 
 		 338 aa  266  5e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.397881  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  45.56 
 
 		 439 aa  264  2e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  46.2 
 
 		 346 aa  263  3e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  46.81 
 
 		 338 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  45.88 
 
 		 354 aa  262  8e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.53 
 
 		 417 aa  261  8.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  46.13 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  47.53 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  45.59 
 
 		 354 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  49.24 
 
 		 419 aa  261  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  46.39 
 
 		 338 aa  260  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  45.59 
 
 		 354 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.95 
 
 		 434 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.57 
 
 		 336 aa  259  7e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  45.04 
 
 		 435 aa  257  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  46.22 
 
 		 338 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.78 
 
 		 333 aa  257  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  47.06 
 
 		 338 aa  256  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  44.76 
 
 		 435 aa  256  4e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  45.29 
 
 		 338 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.04 
 
 		 348 aa  256  6e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  46.75 
 
 		 338 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.43 
 
 		 438 aa  254  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1586  GTPase ObgE  46.65 
 
 		 342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0414808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  45.51 
 
 		 350 aa  253  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  45.73 
 
 		 424 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  44.85 
 
 		 423 aa  252  7e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  45.06 
 
 		 348 aa  252  8.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.34 
 
 		 350 aa  251  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  46.44 
 
 		 356 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3419  GTPase ObgE  47.71 
 
 		 345 aa  251  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.86 
 
 		 425 aa  250  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.25 
 
 		 426 aa  249  6e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  47.8 
 
 		 428 aa  249  7e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  44.74 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.25 
 
 		 415 aa  248  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  42.9 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  43.23 
 
 		 348 aa  247  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  44.65 
 
 		 343 aa  246  3e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.99 
 
 		 369 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  46.34 
 
 		 434 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  47.17 
 
 		 354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  43.64 
 
 		 427 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  44.07 
 
 		 428 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  44.44 
 
 		 341 aa  245  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  46.44 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  44.07 
 
 		 391 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  44.41 
 
 		 432 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.82 
 
 		 680 aa  245  9.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.75 
 
 		 429 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  40.77 
 
 		 407 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.04 
 
 		 343 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.12 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.91 
 
 		 344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.91 
 
 		 344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.5 
 
 		 463 aa  242  7e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  39.55 
 
 		 408 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.39 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  43.7 
 
 		 422 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  45.12 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  45.13 
 
 		 373 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  45.12 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  41.71 
 
 		 439 aa  240  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2690  GTPase ObgE  42.06 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.931281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  44.51 
 
 		 428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.21 
 
 		 396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2180  GTPase ObgE  43.54 
 
 		 350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236885  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  40.22 
 
 		 407 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0469  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.07 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  44.82 
 
 		 428 aa  239  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  44.82 
 
 		 428 aa  239  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2049  GTPase ObgE  47.85 
 
 		 359 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  41.64 
 
 		 370 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  44.82 
 
 		 428 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  45.12 
 
 		 427 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  41.09 
 
 		 408 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  44.82 
 
 		 428 aa  239  8e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  44.51 
 
 		 428 aa  238  8e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  44.51 
 
 		 428 aa  238  8e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>