104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3580 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3580  hypothetical protein  100 
 
 		 618 aa  1268    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000420617  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1265  hypothetical protein  27.12 
 
 		 584 aa  172  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1008  hypothetical protein  29.4 
 
 		 611 aa  173  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1073  hypothetical protein  29.4 
 
 		 597 aa  173  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788303  normal  0.409514 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1088  hypothetical protein  29.4 
 
 		 611 aa  173  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.654387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0980  hypothetical protein  29.4 
 
 		 597 aa  173  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00400135  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1039  hypothetical protein  29.4 
 
 		 586 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.548133  normal  0.203105 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00909  hypothetical protein  29.4 
 
 		 586 aa  169  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2738  protein of unknown function DUF181  29.4 
 
 		 586 aa  169  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1011  hypothetical protein  29.4 
 
 		 586 aa  169  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000298438  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1002  hypothetical protein  29.4 
 
 		 586 aa  169  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.332512  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2691  hypothetical protein  29.4 
 
 		 586 aa  169  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.864502 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1066  hypothetical protein  29.18 
 
 		 586 aa  169  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0179082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00916  hypothetical protein  29.4 
 
 		 586 aa  169  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2216  hypothetical protein  29.18 
 
 		 586 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.522723  normal  0.321049 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2423  hypothetical protein  29.18 
 
 		 586 aa  167  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00238381  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2343  protein of unknown function DUF181  28.34 
 
 		 587 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1425  hypothetical protein  28.08 
 
 		 586 aa  163  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.824732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2932  hypothetical protein  27.75 
 
 		 578 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000159994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2241  protein of unknown function DUF181  27.45 
 
 		 587 aa  163  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173958  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1704  hypothetical protein  29.22 
 
 		 587 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.202332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2565  hypothetical protein  28.51 
 
 		 576 aa  160  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333323  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  28.36 
 
 		 735 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1999  protein of unknown function DUF181  28.27 
 
 		 587 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86626  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1756  hypothetical protein  27.85 
 
 		 728 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2587  hypothetical protein  28.37 
 
 		 588 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1948  hypothetical protein  28.37 
 
 		 588 aa  155  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00321676  normal  0.0629552 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2675  hypothetical protein  28.37 
 
 		 588 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4822  hypothetical protein  28.05 
 
 		 734 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000227003  normal  0.373155 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39610  hypothetical protein  25.91 
 
 		 616 aa  153  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.812583 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2710  hypothetical protein  26.2 
 
 		 731 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1731  hypothetical protein  27.35 
 
 		 587 aa  152  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219135  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0612  hypothetical protein  25.55 
 
 		 582 aa  151  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.166851 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0890  protein of unknown function DUF181  26 
 
 		 592 aa  150  7e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  27.51 
 
 		 728 aa  150  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  26.52 
 
 		 729 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  26.62 
 
 		 729 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2832  hypothetical protein  24.81 
 
 		 728 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  24.32 
 
 		 728 aa  148  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  26.3 
 
 		 728 aa  148  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  26.41 
 
 		 729 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3592  protein of unknown function DUF181  25.62 
 
 		 734 aa  147  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0680194  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0795  hypothetical protein  25.27 
 
 		 592 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  26.41 
 
 		 728 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  26.3 
 
 		 729 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0463  protein of unknown function DUF181  27.25 
 
 		 540 aa  146  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  26.09 
 
 		 742 aa  146  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28020  hypothetical protein  26.68 
 
 		 734 aa  146  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.458293  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3620  hypothetical protein  26.92 
 
 		 728 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  27.41 
 
 		 742 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2113  hypothetical protein  26.92 
 
 		 728 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  27.16 
 
 		 742 aa  145  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  24.95 
 
 		 727 aa  144  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0114  hypothetical protein  28.15 
 
 		 536 aa  143  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  25.4 
 
 		 732 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3253  hypothetical protein  26.55 
 
 		 728 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3214  hypothetical protein  25.4 
 
 		 734 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.668386  normal  0.254813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  24.77 
 
 		 728 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3211  hypothetical protein  25 
 
 		 728 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.357431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2297  hypothetical protein  26.32 
 
 		 728 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806493 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2073  hypothetical protein  25.63 
 
 		 734 aa  139  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  26.83 
 
 		 728 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3033  hypothetical protein  24.47 
 
 		 728 aa  136  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.431186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  24.52 
 
 		 727 aa  68.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  24.5 
 
 		 575 aa  63.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  25.97 
 
 		 763 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  25.97 
 
 		 763 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  23.64 
 
 		 736 aa  60.5  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  25.97 
 
 		 763 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  25.97 
 
 		 716 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  25.97 
 
 		 844 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  25.97 
 
 		 766 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  25.97 
 
 		 769 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  23.27 
 
 		 575 aa  58.9  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  23.93 
 
 		 584 aa  57.8  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  25.4 
 
 		 745 aa  57  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  25.4 
 
 		 745 aa  57  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  24.49 
 
 		 580 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  23.91 
 
 		 746 aa  55.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  25.77 
 
 		 756 aa  54.3  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  25 
 
 		 745 aa  53.9  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  30.83 
 
 		 572 aa  53.9  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  24.63 
 
 		 745 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  31.15 
 
 		 400 aa  52.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  22.38 
 
 		 752 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  22.95 
 
 		 752 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  31.15 
 
 		 400 aa  51.6  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  23.23 
 
 		 403 aa  51.6  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  31.15 
 
 		 400 aa  51.6  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  22.62 
 
 		 582 aa  51.2  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  25 
 
 		 745 aa  50.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0009  hypothetical protein  25.32 
 
 		 353 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.264047  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  30.3 
 
 		 404 aa  48.1  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  20.74 
 
 		 584 aa  47.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  25.14 
 
 		 403 aa  47.4  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  25.52 
 
 		 403 aa  47  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  21.37 
 
 		 420 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  27.94 
 
 		 420 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  28.19 
 
 		 389 aa  45.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  25.57 
 
 		 757 aa  45.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>