224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1688 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  73.26 
 
 		 187 aa  305  3e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  68.98 
 
 		 187 aa  291  5e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  70.05 
 
 		 187 aa  290  8e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  67.91 
 
 		 187 aa  288  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  66.84 
 
 		 189 aa  281  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  66.84 
 
 		 188 aa  280  7.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  44.02 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  38.12 
 
 		 186 aa  154  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  37.57 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  35.71 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  36.72 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  34.76 
 
 		 209 aa  131  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  34.64 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  36.67 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  34.38 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  34.04 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  34.55 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  32.99 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  33.15 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3962  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  34.66 
 
 		 198 aa  99  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  35.56 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  32.35 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  32.83 
 
 		 198 aa  95.9  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  31.21 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  34.23 
 
 		 186 aa  94.7  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  30.59 
 
 		 216 aa  94.4  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  34.88 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  33.5 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  31.74 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  32.61 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  31.33 
 
 		 208 aa  92.8  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  31.76 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  32.94 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0457  hypothetical protein  31.79 
 
 		 199 aa  91.3  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  34.59 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  31.21 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88895  predicted protein  40.29 
 
 		 288 aa  89.7  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0380911  hitchhiker  0.00603627 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  31.76 
 
 		 193 aa  89  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  32.28 
 
 		 198 aa  89.4  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  33.53 
 
 		 190 aa  88.6  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  32.77 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  30 
 
 		 197 aa  88.6  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  33.53 
 
 		 190 aa  88.6  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  34.64 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  30.99 
 
 		 190 aa  88.2  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  31.74 
 
 		 186 aa  87.4  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  30.38 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  30.85 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  33.13 
 
 		 193 aa  86.3  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  30.36 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  28.07 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  31.55 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  32.28 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  29.65 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  29.78 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  32.97 
 
 		 196 aa  86.3  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  31.87 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  29.94 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  29.94 
 
 		 200 aa  85.9  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4106  protein of unknown function DUF179  32.75 
 
 		 197 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  32.1 
 
 		 187 aa  85.5  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  30.38 
 
 		 191 aa  85.5  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  31.06 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  30.06 
 
 		 189 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  30.06 
 
 		 189 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  31.52 
 
 		 204 aa  85.1  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  31.52 
 
 		 204 aa  85.1  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5768  hypothetical protein  31.52 
 
 		 204 aa  85.1  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  29.75 
 
 		 186 aa  85.1  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  32 
 
 		 189 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  31.74 
 
 		 198 aa  84.7  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  31.21 
 
 		 187 aa  84.7  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  31.21 
 
 		 187 aa  84.7  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  31.21 
 
 		 187 aa  84.7  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  31.61 
 
 		 184 aa  84.3  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  31.1 
 
 		 189 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0850  hypothetical protein  32.26 
 
 		 204 aa  84.3  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5633  protein of unknown function DUF179  29.29 
 
 		 146 aa  84.3  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591685  normal  0.939371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  30.25 
 
 		 188 aa  84.3  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  32 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  31.46 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  30.32 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  30.81 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  28.65 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  32.03 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  28.82 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  28.65 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  32.03 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  32.24 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  33.5 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  28.07 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  29.17 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  29.24 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  29.65 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  29.24 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  29.24 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0481  hypothetical protein  26.32 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.756128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>