38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1421 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  100 
 
 		 253 aa  495  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  36.49 
 
 		 458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  35.64 
 
 		 464 aa  162  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  39.53 
 
 		 436 aa  141  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  35.85 
 
 		 470 aa  120  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  39.63 
 
 		 402 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  36.15 
 
 		 417 aa  115  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3472  hypothetical protein  34.88 
 
 		 455 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0090694  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0293  hypothetical protein  32.7 
 
 		 404 aa  109  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0247634  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  28.91 
 
 		 417 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  33.49 
 
 		 409 aa  99  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  31.46 
 
 		 394 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  30.52 
 
 		 394 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  31.46 
 
 		 394 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2554  hypothetical protein  30.51 
 
 		 346 aa  91.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.990789  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  33.77 
 
 		 394 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  29.72 
 
 		 413 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  31.94 
 
 		 414 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  31.94 
 
 		 414 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  26.51 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  26.64 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  32.26 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2709  hypothetical protein  26.33 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  32.29 
 
 		 344 aa  67  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  27.81 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  28.1 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  26.8 
 
 		 472 aa  63.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  26.06 
 
 		 411 aa  62.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  30.37 
 
 		 422 aa  62.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0164  hypothetical protein  26.17 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489222  normal  0.0160984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0220  hypothetical protein  26.56 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0123  hypothetical protein  25.79 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  27.78 
 
 		 345 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6889  hypothetical protein  27.03 
 
 		 319 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1955  hypothetical protein  26.79 
 
 		 352 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0022  hypothetical protein  27.04 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  21.48 
 
 		 454 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4183  hypothetical protein  24.44 
 
 		 348 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>