161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1459 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1459  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
346 aa  700    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00514335  hitchhiker  0.00279802 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0109  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.93 
 
 
402 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84899  normal  0.0173656 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3985  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 
390 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0595818 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4681  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.89 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4333  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
390 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4473  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4278  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
385 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.033432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3000  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
384 aa  72.8  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0763479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 
387 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0456  glycosyl transferase, group 1  22.61 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0645545  hitchhiker  0.00671618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1802  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
371 aa  69.3  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0402  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4593  glycosyl transferase group 1  21.71 
 
 
363 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196645  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3569  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
460 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 
386 aa  57  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  22.99 
 
 
376 aa  56.6  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 
398 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 
386 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  27.22 
 
 
935 aa  53.9  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2529  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
487 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0220634  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  32.85 
 
 
358 aa  53.5  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
420 aa  53.1  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  26.38 
 
 
429 aa  53.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  26.15 
 
 
350 aa  53.1  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  22.39 
 
 
376 aa  53.1  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  22.45 
 
 
379 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0292  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937851  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6431  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
380 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
385 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 
399 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 
358 aa  51.6  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
310 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  24.28 
 
 
376 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0894  a-glycosyltransferase  22.86 
 
 
380 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00308239  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0209  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
386 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  22.58 
 
 
376 aa  50.8  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 
346 aa  50.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1955  glycosyl transferase group 1  23.74 
 
 
768 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.303263  normal  0.277598 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
388 aa  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2089  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
379 aa  50.1  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44458  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  25.29 
 
 
395 aa  50.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.15 
 
 
372 aa  49.7  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  25 
 
 
398 aa  49.7  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0055  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 
376 aa  49.7  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.557703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 
410 aa  49.7  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  25.25 
 
 
387 aa  49.3  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07315  glycosyltransferase  22.02 
 
 
377 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.160223  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 
392 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0219  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
360 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.36 
 
 
373 aa  48.9  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
351 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0483  glycosyl transferase, group 1  21.9 
 
 
370 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0426  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
386 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 
381 aa  49.3  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6235  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
381 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93613  normal  0.352956 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  18.71 
 
 
354 aa  48.5  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
389 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  21.41 
 
 
419 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0229  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
386 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0736189  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  35.85 
 
 
355 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
400 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  22.32 
 
 
355 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  24.29 
 
 
379 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2561  glycosyl transferase, group 1  20.91 
 
 
355 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
389 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
396 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1066  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
368 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
388 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 
518 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 
413 aa  47  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1005  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
357 aa  47.4  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.105019  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 
384 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 
461 aa  47  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
362 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 
388 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 
388 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0307  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
396 aa  46.6  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.813373  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  21.02 
 
 
355 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
388 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  22.17 
 
 
366 aa  46.2  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  24.39 
 
 
398 aa  46.2  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  25.53 
 
 
486 aa  46.2  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4246  glycosyl transferase group 1  22.36 
 
 
753 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
412 aa  46.2  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5057  glycosyl transferase, group 1  20.69 
 
 
359 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1727  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
389 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00570551  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1247  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 
391 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.174724  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  22.84 
 
 
366 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2032  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
355 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000150613  hitchhiker  0.0000241672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  28.21 
 
 
387 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05800  glycosyltransferase  23.03 
 
 
437 aa  45.4  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.504823  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 
393 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  22.62 
 
 
382 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  28.85 
 
 
393 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
409 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0533  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
504 aa  45.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000739824  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  24.52 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  27.84 
 
 
382 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  34.18 
 
 
406 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>