116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2320 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  100 
 
 
165 aa  335  9.999999999999999e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  36.81 
 
 
148 aa  85.5  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0137  hypothetical protein  39.09 
 
 
146 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000209855  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  36.52 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  36.52 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  48.05 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.540401  normal  0.154785 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0260  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  38.46 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.96 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.75 
 
 
354 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.46 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.91 
 
 
273 aa  67.8  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.3 
 
 
524 aa  67.4  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1209  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  52.73 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0207  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.9 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  38.14 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2944  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  43.59 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4070  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  50.91 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618195  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1249  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  50.91 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000125713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1647  hypothetical protein  50.91 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114343  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4226  hypothetical protein  49.09 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.294612  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  44.44 
 
 
241 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0182  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.55 
 
 
365 aa  62.8  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.630616  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4585  hypothetical protein  37.04 
 
 
135 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52290  hypothetical protein  37.04 
 
 
135 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.378524 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  30.63 
 
 
281 aa  61.2  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  36.08 
 
 
278 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0135  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.63 
 
 
397 aa  60.8  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000192889  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  41.67 
 
 
351 aa  60.8  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1689  lipoprotein, putative  47.27 
 
 
135 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1898  twin-arginine translocation pathway signal  29.71 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3541  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.01 
 
 
145 aa  60.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1727  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  41.43 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000179415  normal  0.7023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  38.64 
 
 
282 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0612  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.43 
 
 
263 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1050  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.74 
 
 
283 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.9 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.21 
 
 
279 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0603  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  44.74 
 
 
220 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112924  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3700  hypothetical protein  45.45 
 
 
135 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00210356  hitchhiker  0.00102012 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3124  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.56 
 
 
143 aa  57.4  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000058993  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.33 
 
 
478 aa  57.4  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  33.33 
 
 
478 aa  57.4  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4560  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.28 
 
 
284 aa  57.4  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98407  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0744  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.91 
 
 
137 aa  57  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0863  protein of unknown function DUF306, MetA and HslJ  32.43 
 
 
137 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3540  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  37.96 
 
 
325 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.57 
 
 
305 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.87 
 
 
251 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.87 
 
 
251 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2767  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.14 
 
 
151 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795518  normal  0.509159 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2767  hypothetical protein  30.83 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1083  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.51 
 
 
279 aa  54.7  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2252  putative lipoprotein  32.89 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208393  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0776  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.27 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0977  hypothetical protein  27.66 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0769  hypothetical protein  31.65 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1244  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  38.16 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0694  hypothetical protein  39.47 
 
 
246 aa  52.4  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00754314  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0923  hypothetical protein  28.17 
 
 
138 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0787  heat shock protein  30 
 
 
166 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0351684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0867  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.33 
 
 
137 aa  52.4  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0644  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  39.47 
 
 
226 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.143261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3641  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.33 
 
 
147 aa  52  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0238  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.88 
 
 
204 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02640  probable secreted protein containing HslJ-like protein  28.75 
 
 
274 aa  51.6  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3302  hypothetical protein  38.16 
 
 
179 aa  51.2  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0761077  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1558  putative heat shock protein  47.92 
 
 
170 aa  51.2  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0443108  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.79 
 
 
234 aa  51.2  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2857  hypothetical protein  29.01 
 
 
143 aa  51.2  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0194304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0275  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.93 
 
 
145 aa  50.8  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1923  hypothetical protein  26.95 
 
 
182 aa  50.8  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.87534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1033  hypothetical protein  26.95 
 
 
182 aa  50.8  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.365055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0834  hypothetical protein  26.95 
 
 
182 aa  50.8  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1186  hypothetical protein  26.95 
 
 
182 aa  50.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323907  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1194  hypothetical protein  26.95 
 
 
182 aa  50.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0316  hypothetical protein  26.95 
 
 
182 aa  50.8  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.25 
 
 
197 aa  50.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0765  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.97 
 
 
138 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3258  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.97 
 
 
138 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.21 
 
 
221 aa  50.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1402  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.61 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.418877  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0864  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.91 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.847217  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3548  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.38 
 
 
138 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3670  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.38 
 
 
138 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.141959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3479  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.38 
 
 
138 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1348  hypothetical protein  26.95 
 
 
224 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2359  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.89 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.714187  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3361  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.97 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0957  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.97 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2272  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.59 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0450921 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0516  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  37.68 
 
 
176 aa  48.5  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0590  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  39.47 
 
 
140 aa  48.5  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.927794 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2239  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.08 
 
 
181 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5662  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.08 
 
 
181 aa  47.8  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938365  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0847  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  39.71 
 
 
144 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.687312 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0221  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.73 
 
 
484 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.057348  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0748  hypothetical protein  37.66 
 
 
275 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1708  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.27 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2320  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.27 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2343  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.27 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0123815 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>