More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10920 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  100 
 
 		 186 aa  380  1e-105  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  78.8 
 
 		 185 aa  317  5e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  63.04 
 
 		 184 aa  251  6e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  53.04 
 
 		 184 aa  216  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  53.23 
 
 		 186 aa  214  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0708  ribosome recycling factor  56.18 
 
 		 181 aa  213  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000756586  unclonable  0.0000000210923 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  51.61 
 
 		 186 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  52.15 
 
 		 186 aa  209  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  51.61 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  53.55 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  52.54 
 
 		 184 aa  202  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  53.55 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  53.01 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 185 aa  201  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  51.91 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  52.46 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  52.46 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  52.46 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  51.91 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  51.37 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  52.46 
 
 		 185 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  52.46 
 
 		 185 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 184 aa  197  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  50.83 
 
 		 181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  195  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 184 aa  195  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  50.83 
 
 		 181 aa  195  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1901  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  194  4.0000000000000005e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.782843 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  194  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 185 aa  194  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 192 aa  194  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1963  ribosome recycling factor  51.65 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.566814  normal  0.0766357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  48.09 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3579  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 184 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  47.03 
 
 		 225 aa  187  5.999999999999999e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1164  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 185 aa  187  8e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 192 aa  187  8e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 182 aa  187  9e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1046  ribosome recycling factor  50 
 
 		 183 aa  186  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197511  normal  0.0713595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  49.14 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 182 aa  185  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  48.86 
 
 		 183 aa  185  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3988  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  184  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  48.02 
 
 		 184 aa  184  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1532  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0437112 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0660  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  45.16 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  45.16 
 
 		 186 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  45 
 
 		 182 aa  181  8.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  43.96 
 
 		 184 aa  180  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12187  predicted protein  50.29 
 
 		 176 aa  180  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 184 aa  180  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41282  predicted protein  47.98 
 
 		 173 aa  179  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000037701  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  44.09 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1387  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1325  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1278  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1233  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.408531  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 174 aa  178  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0241  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1384  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000556086  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  48.59 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  45.05 
 
 		 184 aa  178  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  46.63 
 
 		 186 aa  178  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  45.05 
 
 		 184 aa  178  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0647  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 186 aa  177  5.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222194  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  43.72 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1463  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.318607  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  44.09 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1430  ribosome recycling factor  46.07 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>