More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3019 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3019  S-layer domain protein  100 
 
 		 609 aa  1207    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  51.83 
 
 		 2375 aa  435  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  49.37 
 
 		 3320 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0298  hypothetical protein  44.52 
 
 		 1457 aa  350  4e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00924887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  39.04 
 
 		 2073 aa  317  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0422  cell wall/surface repeat protein  37.62 
 
 		 1729 aa  262  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00920532  hitchhiker  0.0000607429 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  32.21 
 
 		 631 aa  219  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.89 
 
 		 6885 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  30.04 
 
 		 2207 aa  165  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0608  S-layer domain protein  32.54 
 
 		 547 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.453799  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  32.59 
 
 		 2286 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  26.92 
 
 		 1847 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  36.41 
 
 		 1042 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  32.81 
 
 		 1260 aa  109  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.51 
 
 		 1661 aa  107  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  35.75 
 
 		 729 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000080624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  27.14 
 
 		 756 aa  103  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  33.82 
 
 		 618 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.98 
 
 		 1016 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  29.89 
 
 		 524 aa  102  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  28.75 
 
 		 548 aa  95.5  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.37 
 
 		 1029 aa  93.6  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  31.84 
 
 		 1013 aa  91.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  30.11 
 
 		 414 aa  90.9  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0792  cell wall hydrolase/autolysin  27.33 
 
 		 530 aa  87.8  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000364595  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  27.74 
 
 		 693 aa  87  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  29.48 
 
 		 930 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  25.84 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0841  S-layer protein Sap  28.9 
 
 		 814 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0885  s-layer protein sap  28.9 
 
 		 814 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  30.43 
 
 		 1009 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  32.62 
 
 		 880 aa  84  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0789  S-layer protein sap precursor  28.32 
 
 		 814 aa  84  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1889  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.48 
 
 		 414 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000270589  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1938  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  29.48 
 
 		 414 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000112204  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  29.51 
 
 		 733 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2644  cell wall/surface repeat protein  30.11 
 
 		 2178 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.615501  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  30.77 
 
 		 1495 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.67 
 
 		 1054 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.07 
 
 		 995 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  26.53 
 
 		 932 aa  82  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1065  S-layer protein EA1  28.25 
 
 		 859 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000432724  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  27.02 
 
 		 573 aa  80.9  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  29.61 
 
 		 807 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  29.84 
 
 		 1226 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0790  S-layer protein, EA1 protein  27.12 
 
 		 861 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0842  S-layer protein EA1  27.12 
 
 		 862 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00698001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1628  S-layer protein and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion protein  27.75 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000159428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0887  s-layer protein ea1  27.12 
 
 		 862 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000735579  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1682  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.17 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000845994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1862  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  27.17 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.72375e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1817  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.17 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000725042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  30.7 
 
 		 554 aa  76.6  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0800  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.56 
 
 		 529 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000328713  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  22.4 
 
 		 1174 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1079  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.87 
 
 		 529 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000334554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0089  S-layer domain protein  26.79 
 
 		 807 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025043 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0984  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.87 
 
 		 529 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000810888  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  27.27 
 
 		 822 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000577462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0851  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.77 
 
 		 529 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000657012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0898  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.77 
 
 		 529 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000140449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  27.78 
 
 		 526 aa  74.7  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0986  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.77 
 
 		 529 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.46837e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0940  S-layer protein  25 
 
 		 535 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000994264  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4391  S-layer protein  25 
 
 		 535 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000169647  unclonable  1.31184e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0975  S-layer protein EA1  27.93 
 
 		 863 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000553738 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  27.67 
 
 		 506 aa  74.3  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  28.65 
 
 		 758 aa  73.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  24.54 
 
 		 548 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  28.65 
 
 		 1821 aa  73.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  28.9 
 
 		 1321 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  29.35 
 
 		 413 aa  73.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  26.92 
 
 		 542 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  26.92 
 
 		 765 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  25.27 
 
 		 755 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3111  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.46 
 
 		 539 aa  72  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000635651  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  26.42 
 
 		 413 aa  72  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  30.69 
 
 		 489 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  25.27 
 
 		 766 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0715  S-layer domain-containing protein  25.43 
 
 		 879 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3210  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.51 
 
 		 533 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0079  surface layer protein  30.56 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  2.3790999999999998e-28  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5468  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.51 
 
 		 533 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000294756  normal  0.0109567 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  28.99 
 
 		 920 aa  71.2  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  28.35 
 
 		 921 aa  71.2  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  29.53 
 
 		 542 aa  70.9  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0724  cell wall hydrolase/autolysin  25.43 
 
 		 527 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000386208  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3789  cell wall hydrolase/autolysin  25.97 
 
 		 538 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2393  S-layer domain protein  27.62 
 
 		 522 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000002124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  27.57 
 
 		 1208 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0974  S-layer protein  26.55 
 
 		 819 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000842335 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2329  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.06 
 
 		 596 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0903  S-layer protein  26.09 
 
 		 379 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000949153  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3307  S-layer domain protein  27.22 
 
 		 360 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  26.55 
 
 		 710 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  26.37 
 
 		 772 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  29.95 
 
 		 754 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3449  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.05 
 
 		 843 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  28.57 
 
 		 484 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  26.37 
 
 		 779 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>