265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1050 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  100 
 
 		 702 aa  1444    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  40.8 
 
 		 702 aa  521  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  32.15 
 
 		 768 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  32.15 
 
 		 778 aa  340  7e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  32.55 
 
 		 780 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  33.59 
 
 		 753 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  32.74 
 
 		 776 aa  335  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  32.3 
 
 		 776 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  32.74 
 
 		 776 aa  335  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  32.74 
 
 		 776 aa  335  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  32.59 
 
 		 777 aa  334  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  32.44 
 
 		 777 aa  332  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  32 
 
 		 777 aa  329  9e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  32 
 
 		 778 aa  327  6e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  32.67 
 
 		 691 aa  310  4e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  32.41 
 
 		 689 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  32.46 
 
 		 689 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  32.3 
 
 		 689 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  32.41 
 
 		 689 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  30.46 
 
 		 785 aa  307  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  32.45 
 
 		 689 aa  307  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  32.05 
 
 		 691 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  32.15 
 
 		 689 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  32.06 
 
 		 706 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  32.06 
 
 		 706 aa  304  5.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  32 
 
 		 691 aa  300  7e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  31.94 
 
 		 689 aa  298  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  29.51 
 
 		 762 aa  289  1e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.38 
 
 		 763 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.1 
 
 		 763 aa  282  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  30.24 
 
 		 712 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  29.13 
 
 		 755 aa  270  5.9999999999999995e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1632  ATP-dependent DNA helicase rep  26.8 
 
 		 703 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.08 
 
 		 698 aa  222  1.9999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00160  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.84 
 
 		 706 aa  207  6e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.805287 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1680  superfamily I DNA/RNA helicase  40.93 
 
 		 764 aa  203  9e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.119697  hitchhiker  0.00309861 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  46.27 
 
 		 748 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.05 
 
 		 716 aa  201  3.9999999999999996e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  38.31 
 
 		 787 aa  199  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  32.73 
 
 		 760 aa  190  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  36.86 
 
 		 768 aa  189  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  36.9 
 
 		 772 aa  184  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.35 
 
 		 672 aa  168  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  25.48 
 
 		 680 aa  157  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0360  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.95 
 
 		 736 aa  153  8.999999999999999e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  24.08 
 
 		 659 aa  153  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1135  hypothetical protein  33.73 
 
 		 269 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0285416  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  25.11 
 
 		 695 aa  146  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  23.08 
 
 		 670 aa  137  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  23.77 
 
 		 679 aa  136  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  23.05 
 
 		 717 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  23.6 
 
 		 692 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  21.56 
 
 		 695 aa  132  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0025  UvrD/Rep helicase family protein  25.46 
 
 		 852 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  29.54 
 
 		 727 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  23.68 
 
 		 684 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  34.65 
 
 		 666 aa  128  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  22.48 
 
 		 710 aa  127  9e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  31.89 
 
 		 771 aa  124  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  27.72 
 
 		 792 aa  122  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  34.13 
 
 		 726 aa  120  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.16 
 
 		 645 aa  120  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  33.33 
 
 		 759 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.33 
 
 		 757 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  31.68 
 
 		 799 aa  119  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.13 
 
 		 741 aa  118  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  30.05 
 
 		 706 aa  117  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.91 
 
 		 766 aa  117  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  34.56 
 
 		 726 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 750 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.39 
 
 		 746 aa  114  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  33.93 
 
 		 742 aa  114  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  30.54 
 
 		 719 aa  114  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  30.67 
 
 		 706 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.88 
 
 		 732 aa  113  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  30.52 
 
 		 705 aa  112  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.41 
 
 		 813 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.22 
 
 		 767 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.01 
 
 		 804 aa  110  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.19 
 
 		 705 aa  110  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  31.13 
 
 		 829 aa  109  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  29.3 
 
 		 734 aa  109  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  33.5 
 
 		 795 aa  108  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.67 
 
 		 832 aa  108  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  29.86 
 
 		 759 aa  107  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.44 
 
 		 685 aa  107  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  31.37 
 
 		 742 aa  107  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  29.67 
 
 		 902 aa  106  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.11 
 
 		 693 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  29.01 
 
 		 724 aa  106  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  29.01 
 
 		 724 aa  106  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  30.2 
 
 		 703 aa  105  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  25.89 
 
 		 765 aa  104  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  28.73 
 
 		 724 aa  104  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.97 
 
 		 786 aa  103  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.64 
 
 		 748 aa  102  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.34 
 
 		 691 aa  102  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.19 
 
 		 758 aa  102  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  27.27 
 
 		 735 aa  102  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  34.63 
 
 		 754 aa  100  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>