More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0764 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  100 
 
 		 222 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  86.05 
 
 		 226 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  70.91 
 
 		 221 aa  339  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  70.45 
 
 		 221 aa  335  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  71.82 
 
 		 220 aa  328  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  67.73 
 
 		 222 aa  319  3e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  67.73 
 
 		 222 aa  319  3e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  68.92 
 
 		 219 aa  317  7.999999999999999e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  70.48 
 
 		 222 aa  315  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  68.42 
 
 		 218 aa  313  9e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  68.4 
 
 		 214 aa  313  9e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  65.91 
 
 		 220 aa  312  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  65.91 
 
 		 219 aa  308  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  66.82 
 
 		 218 aa  302  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  66.67 
 
 		 218 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  66.36 
 
 		 238 aa  302  3.0000000000000004e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  67.94 
 
 		 219 aa  298  6e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  64.59 
 
 		 226 aa  294  7e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  64.62 
 
 		 211 aa  291  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  63.21 
 
 		 211 aa  291  6e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  64.62 
 
 		 211 aa  291  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  63.03 
 
 		 229 aa  288  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  64.59 
 
 		 210 aa  288  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  61.82 
 
 		 219 aa  287  9e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  64.62 
 
 		 217 aa  286  1e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  60.71 
 
 		 224 aa  286  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  60.71 
 
 		 224 aa  286  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  63.94 
 
 		 210 aa  286  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  63.64 
 
 		 210 aa  286  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  61.32 
 
 		 211 aa  285  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  60.71 
 
 		 224 aa  285  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  60.36 
 
 		 221 aa  285  4e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  65.07 
 
 		 217 aa  283  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  65.07 
 
 		 217 aa  283  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  60.27 
 
 		 224 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  63.68 
 
 		 217 aa  281  8.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  60 
 
 		 219 aa  279  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  60 
 
 		 219 aa  279  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  60 
 
 		 219 aa  279  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  60 
 
 		 219 aa  279  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  60 
 
 		 219 aa  279  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  60 
 
 		 219 aa  279  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  60 
 
 		 219 aa  279  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  60.45 
 
 		 219 aa  280  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  60 
 
 		 219 aa  279  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  60 
 
 		 219 aa  279  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  63.64 
 
 		 217 aa  278  7e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 210 aa  275  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  62.26 
 
 		 217 aa  275  5e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2327  30S ribosomal protein S3  63.85 
 
 		 227 aa  274  9e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000359117  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 245 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2366  30S ribosomal protein S3  55.86 
 
 		 223 aa  270  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 244 aa  267  8e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0762  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 244 aa  266  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00068895  normal  0.0518908 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0714  ribosomal protein S3  58.1 
 
 		 216 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874756  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  58.65 
 
 		 210 aa  265  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  56.76 
 
 		 226 aa  265  5e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3999  ribosomal protein S3  56.94 
 
 		 223 aa  264  7e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 223 aa  263  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  59.81 
 
 		 262 aa  264  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  56.31 
 
 		 222 aa  263  1e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1092  SSU ribosomal protein S3P  57.49 
 
 		 288 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04040  SSU ribosomal protein S3P  55.4 
 
 		 286 aa  263  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0666  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 213 aa  262  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00146093  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  57 
 
 		 278 aa  262  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6043  30S ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 325 aa  261  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  57.89 
 
 		 395 aa  261  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1561  ribosomal protein S3  58.37 
 
 		 233 aa  261  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  58.17 
 
 		 223 aa  261  4.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6608  ribosomal protein S3  54.09 
 
 		 275 aa  261  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1178  ribosomal protein S3  56.95 
 
 		 223 aa  260  8.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000314343  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  57.78 
 
 		 228 aa  260  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0588  30S ribosomal protein S3  55.29 
 
 		 315 aa  260  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4315  ribosomal protein S3  54.63 
 
 		 272 aa  259  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0333  ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 228 aa  259  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0503  ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 220 aa  259  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.216514  hitchhiker  0.000000000339097 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2251  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 213 aa  259  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000614716  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  57.89 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  55.25 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 232 aa  258  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 232 aa  258  4e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336971  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  56.46 
 
 		 241 aa  258  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_423  ribosomal protein S3  54.13 
 
 		 278 aa  258  4e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652723  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 232 aa  258  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4538  30S ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 232 aa  258  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5130  ribosomal protein S3  55.45 
 
 		 268 aa  258  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.805435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0065  30S ribosomal protein S3  56.73 
 
 		 235 aa  258  6e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0358705  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0085  30S ribosomal protein S3  58.17 
 
 		 213 aa  258  6e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0561951 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0411  30S ribosomal protein S3  56.73 
 
 		 233 aa  258  7e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0480  30S ribosomal protein S3  54.13 
 
 		 278 aa  257  9e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  58.17 
 
 		 236 aa  257  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3816  30S ribosomal protein S3  56.73 
 
 		 233 aa  257  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000890302  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3995  30S ribosomal protein S3  56.73 
 
 		 233 aa  257  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0329  30S ribosomal protein S3  56.73 
 
 		 233 aa  257  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000157005  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0399  30S ribosomal protein S3  56.25 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000141068  hitchhiker  0.0000729403 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3738  30S ribosomal protein S3  56.25 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.338082  normal  0.0279522 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3630  30S ribosomal protein S3  56.25 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000937087  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1759  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 212 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.341094  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4637  30S ribosomal protein S3  56.25 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00278022  normal  0.0942567 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0457  30S ribosomal protein S3  53.85 
 
 		 278 aa  256  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>