122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3916 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3916  HK97 family phage portal protein  100 
 
 		 384 aa  762    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0348958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  62.5 
 
 		 391 aa  453  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1801  Phage portal protein, HK97  61.35 
 
 		 391 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595196  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  59.73 
 
 		 391 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3150  HK97 family phage portal protein  60.1 
 
 		 393 aa  421  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273725  normal  0.0302627 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1966  Phage portal protein, HK97  59.19 
 
 		 391 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  57.03 
 
 		 391 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  58.06 
 
 		 391 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  55.68 
 
 		 391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1433  HK97 family phage portal protein  57.96 
 
 		 390 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.273066 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2901  HK97 family phage portal protein  54.95 
 
 		 400 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149993  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2177  putative phage portal protein  53.63 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1707  phage portal protein, HK97 family  57.07 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.449207  normal  0.0531802 
 
 
-
 
NC_004310  BR0586  HK97 family portal protein  55.59 
 
 		 397 aa  375  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1632  Phage portal protein, HK97  52.63 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1130  HK97 family phage portal protein  54.59 
 
 		 390 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.868122  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0587  HK97 family phage portal protein  55.59 
 
 		 397 aa  375  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1429  phage portal protein, HK97 family  59.38 
 
 		 386 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  normal  0.284789 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2468  putative portal protein  54.33 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1075  HK97 family phage portal protein  54.69 
 
 		 388 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.529897  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  51.07 
 
 		 401 aa  359  6e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1334  phage portal protein HK97 family  53.1 
 
 		 400 aa  355  5.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00597949  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4963  HK97 family phage portal protein  55.21 
 
 		 397 aa  341  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000373526 
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  45.77 
 
 		 397 aa  337  9.999999999999999e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0919  HK97 family phage portal protein  55.29 
 
 		 351 aa  318  7.999999999999999e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.38293 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  40.82 
 
 		 393 aa  316  5e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  40.56 
 
 		 393 aa  315  9.999999999999999e-85  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3119  Phage portal protein, HK97  48.86 
 
 		 389 aa  299  6e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0007  HK97 family phage portal protein  42.66 
 
 		 396 aa  295  6e-79  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000540327  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2002  Phage portal protein, HK97  50.43 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443505  hitchhiker  0.004041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3705  HK97 family phage portal protein  44.51 
 
 		 477 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0697  HK97 family phage portal protein  31.49 
 
 		 399 aa  141  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.25481e-17 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  30.87 
 
 		 384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  28.62 
 
 		 444 aa  106  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  29 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  28.91 
 
 		 440 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  28.21 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  27.88 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  30.66 
 
 		 407 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  26.58 
 
 		 420 aa  97.1  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  28.23 
 
 		 413 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  28.23 
 
 		 413 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  24.55 
 
 		 425 aa  94  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  28.23 
 
 		 413 aa  94  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  24.55 
 
 		 425 aa  94  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  24.55 
 
 		 425 aa  94  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  25.87 
 
 		 411 aa  92.8  8e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  26.1 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  24.74 
 
 		 524 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  25 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  27.06 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  25.6 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2854  portal protein  24.69 
 
 		 1102 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279665  hitchhiker  0.00446406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  29.8 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  26.27 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  29.9 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  25.75 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  29.24 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  26.07 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  22.93 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  25.55 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  24.74 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  26.88 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  23.06 
 
 		 445 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  28.06 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  28.06 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  26.38 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  27.18 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  25.8 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  27.49 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3880  portal protein  22.49 
 
 		 479 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.100107  normal  0.024166 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  24.01 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  27.22 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  24.65 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  25.47 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  23.85 
 
 		 431 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  21.84 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  26.15 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  27.86 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  26.15 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  25.77 
 
 		 445 aa  62.8  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  25.6 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  25.41 
 
 		 473 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  21.4 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  25.71 
 
 		 455 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  25.71 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  20.55 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  25 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  24.19 
 
 		 544 aa  60.1  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  30.52 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3484  portal protein  23.84 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  24.65 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0671  HK97 family phage portal protein  22.49 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  23.53 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  25.58 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0650  phage portal protein  22.3 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  29.55 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  24.91 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  19.46 
 
 		 448 aa  56.2  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  22.35 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>