More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1494 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  100 
 
 
418 aa  843  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  52.18 
 
 
431 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  53.38 
 
 
432 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  52.06 
 
 
445 aa  419  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  53.04 
 
 
436 aa  418  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  52.06 
 
 
445 aa  420  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  52.84 
 
 
417 aa  415  1e-115  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  52.94 
 
 
449 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  53.08 
 
 
417 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  51.31 
 
 
417 aa  409  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  51.09 
 
 
453 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  50 
 
 
423 aa  407  1e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  51.21 
 
 
436 aa  407  1e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  51.21 
 
 
429 aa  407  1e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  52.28 
 
 
432 aa  407  1e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  51.46 
 
 
430 aa  406  1e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1745  DNA polymerase IV  51.46 
 
 
428 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7420  DNA polymerase IV  53.24 
 
 
429 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108606  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1285  DNA polymerase IV  50 
 
 
431 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25949  normal  0.0407739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  50.12 
 
 
435 aa  398  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  50.98 
 
 
431 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0385  DNA polymerase IV  52.39 
 
 
417 aa  396  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.434794  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2445  DNA polymerase IV  49.88 
 
 
429 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255034  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  50.97 
 
 
429 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5188  DNA polymerase IV  52.73 
 
 
425 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  52.62 
 
 
435 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  50.24 
 
 
423 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4721  DNA polymerase IV  52.73 
 
 
425 aa  395  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5260  DNA polymerase IV  52.35 
 
 
415 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2844  DNA polymerase IV  51.81 
 
 
411 aa  375  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.900402  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1429  DNA polymerase IV  48.43 
 
 
429 aa  374  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.587123  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3530  DNA polymerase IV  51.04 
 
 
421 aa  348  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  45.07 
 
 
410 aa  265  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  40.56 
 
 
426 aa  257  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  39.8 
 
 
430 aa  257  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  39.15 
 
 
425 aa  257  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  40.21 
 
 
384 aa  256  4e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  41.88 
 
 
417 aa  256  7e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  40.92 
 
 
399 aa  254  2e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  43.63 
 
 
419 aa  253  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  42.73 
 
 
481 aa  254  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  44.97 
 
 
418 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  44.97 
 
 
418 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  47.3 
 
 
420 aa  250  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  41.88 
 
 
386 aa  250  4e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  44.18 
 
 
430 aa  249  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  42.82 
 
 
415 aa  249  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  43.98 
 
 
399 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  42.98 
 
 
419 aa  247  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  42.44 
 
 
424 aa  247  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  44.97 
 
 
418 aa  247  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  36.69 
 
 
393 aa  245  9e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  41.67 
 
 
363 aa  244  2e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  36.73 
 
 
385 aa  242  7e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  37.24 
 
 
408 aa  242  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  38.67 
 
 
412 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  2.72693e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  39.95 
 
 
390 aa  240  3e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  41.88 
 
 
380 aa  240  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  43.49 
 
 
354 aa  240  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  38.64 
 
 
390 aa  239  5e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  37.56 
 
 
397 aa  239  5e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  40.26 
 
 
414 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  44.84 
 
 
356 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  41.76 
 
 
466 aa  237  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  41.71 
 
 
356 aa  237  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  39.48 
 
 
391 aa  237  3e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  39.32 
 
 
408 aa  236  8e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  43.06 
 
 
369 aa  235  1e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  39.22 
 
 
371 aa  235  1e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  40.53 
 
 
385 aa  235  1e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  40.85 
 
 
406 aa  234  2e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  38.35 
 
 
358 aa  233  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  41.23 
 
 
378 aa  232  7e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  41.69 
 
 
402 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  43.48 
 
 
355 aa  231  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  39.32 
 
 
407 aa  229  5e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  38.22 
 
 
395 aa  229  8e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  41.3 
 
 
409 aa  229  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  41.59 
 
 
357 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  37.86 
 
 
400 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  42.67 
 
 
422 aa  227  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  3.25025e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1587  DNA polymerase IV  42.18 
 
 
362 aa  227  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  42.73 
 
 
360 aa  227  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  38.5 
 
 
408 aa  226  7e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  41.3 
 
 
357 aa  226  8e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  42.15 
 
 
369 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  34.63 
 
 
409 aa  225  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2071  DNA-directed DNA polymerase  45.76 
 
 
348 aa  225  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1555  DNA-directed DNA polymerase  39.45 
 
 
422 aa  224  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.558973  normal  0.0210398 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  41.18 
 
 
378 aa  223  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  36.75 
 
 
385 aa  222  7e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  38.01 
 
 
369 aa  222  8e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  7.22148e-10  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  40.53 
 
 
365 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  44.63 
 
 
383 aa  221  1e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  44.63 
 
 
361 aa  222  1e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  44.63 
 
 
408 aa  222  1e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  39.35 
 
 
363 aa  221  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  44.75 
 
 
405 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  36.83 
 
 
413 aa  220  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  37.66 
 
 
407 aa  220  4e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>