More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0819 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
180 aa  363  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 
158 aa  155  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  46.5 
 
 
159 aa  153  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 
155 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  44.16 
 
 
157 aa  148  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  43.51 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 
156 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0703  AsnC family transcriptional regulator  43.67 
 
 
159 aa  145  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0327834  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  46.75 
 
 
155 aa  144  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 
156 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  43.51 
 
 
156 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 
156 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  47.02 
 
 
155 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  47.5 
 
 
165 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.71 
 
 
156 aa  141  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 
169 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  45.1 
 
 
169 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0007  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 
169 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 
159 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
152 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 
169 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
156 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
152 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
152 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
152 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
152 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
156 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
152 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
152 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
152 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
152 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
152 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
156 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  44.67 
 
 
152 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
156 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
156 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
152 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0671  transcriptional regulator, AsnC family  45.03 
 
 
160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.633798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  48.63 
 
 
166 aa  135  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
166 aa  134  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 
152 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
171 aa  134  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 
154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 
156 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
156 aa  130  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  42.68 
 
 
157 aa  130  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
153 aa  130  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  44.74 
 
 
159 aa  130  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 
169 aa  130  9e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  42.31 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2055  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.650647  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
162 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 
166 aa  127  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  41.67 
 
 
162 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.67 
 
 
153 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4847  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2310  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 
153 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.67051  normal  0.0460522 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  39.07 
 
 
156 aa  125  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2595  transcriptional regulator, AsnC family  41.1 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014079  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
159 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
152 aa  124  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2511  transcriptional regulator, AsnC family  45.14 
 
 
167 aa  124  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  42.76 
 
 
154 aa  124  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2235  AsnC/Lrp family regulatory protein  45.14 
 
 
167 aa  124  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
155 aa  124  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 
153 aa  124  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
157 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
159 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
156 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2193  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 
167 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 
156 aa  122  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  42.76 
 
 
159 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  38.96 
 
 
161 aa  122  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  38.96 
 
 
161 aa  122  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  42.76 
 
 
169 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01449  hypothetical protein  37.33 
 
 
155 aa  122  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
156 aa  122  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  41.06 
 
 
154 aa  121  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
159 aa  121  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2964  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
172 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116625  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  42.76 
 
 
159 aa  121  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
159 aa  120  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
158 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
158 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
158 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0850  glutamate uptake regulatory protein Grp  39.22 
 
 
159 aa  120  8e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
158 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.76 
 
 
163 aa  120  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4264  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 
152 aa  120  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898523  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  40 
 
 
160 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  38.65 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>