More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7722 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 269 aa  534  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  75.11 
 
 		 268 aa  350  1e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  68.16 
 
 		 249 aa  324  8.000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  66.95 
 
 		 246 aa  322  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  64.75 
 
 		 248 aa  321  7e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  64.58 
 
 		 242 aa  316  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  62.29 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  63.95 
 
 		 244 aa  292  4e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  66.12 
 
 		 252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  51.3 
 
 		 244 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  47.62 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  47.44 
 
 		 257 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  44.78 
 
 		 246 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 245 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1304  UbiC transcription regulator-associated domain protein  46.09 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1316  GntR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  45.22 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0056  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  43.1 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210738 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3820  transcriptional regulator, GntR family  43.78 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0228383  hitchhiker  0.00324252 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  42.13 
 
 		 247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  43.4 
 
 		 243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  44.92 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  40.52 
 
 		 238 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  41.35 
 
 		 243 aa  162  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  40.66 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  42.68 
 
 		 252 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  39.22 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  41.05 
 
 		 246 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  38.18 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  38.86 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 247 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  36.8 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 240 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  42.13 
 
 		 195 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  42.13 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  38.77 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  42.13 
 
 		 195 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  38.36 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 240 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 241 aa  136  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  35.02 
 
 		 252 aa  135  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  37.72 
 
 		 242 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 241 aa  135  8e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7203  transcriptional regulator, GntR family  37.02 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.277726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 251 aa  132  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  41.98 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4184  transcriptional regulator, GntR family  40.98 
 
 		 185 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000338347  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  40.34 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3517  GntR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 238 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  39.48 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05080  transcriptional regulator  38.94 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.764166  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0076  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 241 aa  119  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 241 aa  119  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 257 aa  119  7.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 257 aa  119  7.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1234  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.98 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.550496  normal  0.0276711 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  32.46 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 239 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  37.61 
 
 		 257 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 256 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 256 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9090  putative transcriptional regulator, GntR family  38.7 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  30.9 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 256 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  36.24 
 
 		 245 aa  115  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.81 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15390  transcriptional regulator  37.66 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.457467 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 242 aa  115  8.999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 232 aa  115  8.999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.253888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>