92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1362 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1362  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 223 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323106  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0298  PadR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0288  PadR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0279  PadR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 221 aa  185  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4568  PadR-like family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2867  PadR-like family transcriptional regulator  50.87 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0615  PadR-like family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  33.58 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  31.79 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  31.79 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  43.4 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  33.59 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  34.81 
 
 		 185 aa  68.2  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  39.24 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  29.84 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  32.2 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  31.63 
 
 		 160 aa  62  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  33.67 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  32.3 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3145  PadR-like family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  25.58 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0613  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121754  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1177  transcriptional regulator, PadR-like family  28.32 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0592255  hitchhiker  0.00870551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  37.25 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  37.97 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5605  PadR-like family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0554701  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  32.48 
 
 		 176 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 176 aa  52  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  34.34 
 
 		 177 aa  52  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  31.25 
 
 		 196 aa  51.6  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  38.36 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6303  transcriptional regulator, PadR-like family  34.52 
 
 		 188 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113883  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4651  PadR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0244523  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  43.04 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  36.71 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 185 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  33.6 
 
 		 172 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  43.04 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 179 aa  50.1  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  37.97 
 
 		 174 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  27.27 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 183 aa  50.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  19.72 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2598  transcriptional regulator PadR family protein  38.89 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 183 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  35.82 
 
 		 179 aa  49.3  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  34 
 
 		 187 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  29.56 
 
 		 176 aa  48.9  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3673  PadR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 189 aa  48.9  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  28.07 
 
 		 179 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  28.07 
 
 		 179 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4476  PadR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5591  PadR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2808  PadR-like family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 180 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  34.33 
 
 		 179 aa  46.2  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 184 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2796  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 187 aa  46.2  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1343  transcriptional regulator PadR family protein  27.4 
 
 		 186 aa  45.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2505  Transcriptional regulator PadR-like protein  31.03 
 
 		 195 aa  45.4  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.774349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4863  transcriptional regulator, PadR-like family  31.01 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4824  transcriptional regulator, PadR-like family  31.51 
 
 		 184 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06690  predicted transcriptional regulator  21.33 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000111873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 272 aa  43.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  25.84 
 
 		 179 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 185 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0979  transcriptional regulator PadR family protein  27.43 
 
 		 191 aa  42.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07680  predicted transcriptional regulator  28.35 
 
 		 166 aa  42.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  32 
 
 		 194 aa  42.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  28.74 
 
 		 178 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  29.75 
 
 		 191 aa  42  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 181 aa  42  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 187 aa  42  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 118 aa  42  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>