264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4290 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4290  homoserine kinase  100 
 
 		 328 aa  672    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004456  homoserine kinase  55.06 
 
 		 323 aa  356  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00940  homoserine kinase  53.16 
 
 		 323 aa  347  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  54.57 
 
 		 309 aa  341  9e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2555  homoserine kinase  54.6 
 
 		 318 aa  340  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3667  homoserine kinase  54.26 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.478541  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1942  homoserine kinase  54.29 
 
 		 318 aa  338  5e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17619  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  52.87 
 
 		 310 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  52.87 
 
 		 310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  52.87 
 
 		 310 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  52.87 
 
 		 310 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  52.87 
 
 		 310 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  52.87 
 
 		 310 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  52.87 
 
 		 310 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0534  homoserine kinase  53.63 
 
 		 309 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  52.87 
 
 		 310 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  52.55 
 
 		 310 aa  335  7e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  52.87 
 
 		 309 aa  334  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  52.87 
 
 		 309 aa  334  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  52.87 
 
 		 309 aa  334  1e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  54.14 
 
 		 309 aa  333  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  52.55 
 
 		 309 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  52.23 
 
 		 309 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  52.23 
 
 		 309 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  52.23 
 
 		 309 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  52.23 
 
 		 309 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  53 
 
 		 309 aa  329  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3579  homoserine kinase  50.61 
 
 		 331 aa  325  5e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  52.23 
 
 		 309 aa  325  7e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1213  homoserine kinase  50.78 
 
 		 314 aa  322  4e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241016  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1271  homoserine kinase  51.26 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1276  homoserine kinase  49.84 
 
 		 318 aa  296  3e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03327  homoserine kinase  50.48 
 
 		 315 aa  293  4e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1176  homoserine kinase  49.52 
 
 		 312 aa  292  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3414  homoserine kinase  49.06 
 
 		 312 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0906  homoserine kinase  49.04 
 
 		 314 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1080  homoserine kinase  48.11 
 
 		 316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.708816  normal  0.284936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1210  homoserine kinase  48.74 
 
 		 312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1139  homoserine kinase  48.43 
 
 		 312 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3085  homoserine kinase  46.44 
 
 		 321 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479885  hitchhiker  0.00212807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1272  homoserine kinase  47.37 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140701  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1140  homoserine kinase  48.43 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0308198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1228  homoserine kinase  47.37 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0499672  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1305  homoserine kinase  47.37 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2734  homoserine kinase  47.68 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2905  homoserine kinase  47.77 
 
 		 319 aa  276  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1067  homoserine kinase  46.86 
 
 		 311 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2739  homoserine kinase  45.12 
 
 		 328 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11354  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  33.44 
 
 		 309 aa  149  7e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  32.25 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3151  homoserine kinase  31.96 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3803  homoserine kinase  33.44 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07415  homoserine kinase  31.75 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  32.17 
 
 		 306 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1357  homoserine kinase  32.01 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1424  homoserine kinase  32.01 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  28.83 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1097  homoserine kinase  34.19 
 
 		 314 aa  116  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1986  homoserine kinase  31.58 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1262  homoserine kinase  29.43 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  28.93 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  30.28 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0296  homoserine kinase  32.92 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1750  homoserine kinase  34.06 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  30.07 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  28.62 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2545  homoserine kinase  30.79 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0629954  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2706  homoserine kinase  31.58 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0261  homoserine kinase  32.34 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.836867  normal  0.0420212 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1057  homoserine kinase  29.31 
 
 		 317 aa  103  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  28.47 
 
 		 302 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  28.21 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  28.22 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0261  homoserine kinase  29.75 
 
 		 308 aa  99.8  7e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000622844 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  30.07 
 
 		 301 aa  99.4  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0041  homoserine kinase  27.76 
 
 		 307 aa  99.4  8e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2333  homoserine kinase  31.48 
 
 		 320 aa  99  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  30.54 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1644  homoserine kinase  29.58 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1023  homoserine kinase  30.03 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0058  homoserine kinase  31.67 
 
 		 291 aa  97.1  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.188045  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0139  homoserine kinase  31.79 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  28.72 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  29.77 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3310  homoserine kinase  29.58 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85224  homoserine kinase  26.77 
 
 		 353 aa  94.4  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.481244  normal  0.37391 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  28.47 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1368  homoserine kinase  27.75 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2302  homoserine kinase  31.4 
 
 		 293 aa  93.6  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.591143  normal  0.310319 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1251  homoserine kinase  29.62 
 
 		 296 aa  92.8  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  26.21 
 
 		 311 aa  92.8  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16080  homoserine kinase  26.58 
 
 		 293 aa  92.4  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.222088  hitchhiker  0.000000158758 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0899  homoserine kinase  27.99 
 
 		 306 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  26.64 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  27.36 
 
 		 317 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  26.94 
 
 		 315 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5430  homoserine kinase  30.19 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1788  homoserine kinase  27.69 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.542876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0538  homoserine kinase  28.71 
 
 		 309 aa  89.7  6e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.283285  unclonable  0.0000000181031 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2422  homoserine kinase  28.67 
 
 		 316 aa  89.4  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>