276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3151 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3151  homoserine kinase  100 
 
 		 309 aa  622  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  69.58 
 
 		 311 aa  441  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  58.44 
 
 		 309 aa  363  2e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3803  homoserine kinase  53.42 
 
 		 311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1986  homoserine kinase  53.44 
 
 		 320 aa  305  6e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2545  homoserine kinase  53.12 
 
 		 320 aa  302  6.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0629954  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0296  homoserine kinase  52.81 
 
 		 320 aa  297  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2333  homoserine kinase  53.89 
 
 		 320 aa  295  5e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2706  homoserine kinase  53.44 
 
 		 320 aa  288  6e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0261  homoserine kinase  50.94 
 
 		 320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.836867  normal  0.0420212 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2574  homoserine kinase  51.47 
 
 		 306 aa  277  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5430  homoserine kinase  51.64 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0139  homoserine kinase  51.56 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07415  homoserine kinase  46.05 
 
 		 308 aa  259  6e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1262  homoserine kinase  39.02 
 
 		 325 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1357  homoserine kinase  40.26 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1424  homoserine kinase  40.26 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1750  homoserine kinase  43.38 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1731 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0041  homoserine kinase  38.08 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1097  homoserine kinase  40.74 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  34.92 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  34.92 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  34.92 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1251  homoserine kinase  39.33 
 
 		 296 aa  169  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  34.41 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0534  homoserine kinase  34.71 
 
 		 309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  34.71 
 
 		 309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3667  homoserine kinase  34.71 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.478541  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  34.5 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00940  homoserine kinase  35.13 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  34.5 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  34.73 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0058  homoserine kinase  37.67 
 
 		 291 aa  164  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.188045  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  34.73 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  34.73 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  34.73 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004456  homoserine kinase  34.18 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2302  homoserine kinase  37.7 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.591143  normal  0.310319 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1644  homoserine kinase  38.54 
 
 		 291 aa  162  7e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  34.19 
 
 		 310 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  34.19 
 
 		 310 aa  162  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  34.19 
 
 		 310 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  34.19 
 
 		 310 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  34.19 
 
 		 310 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  34.19 
 
 		 310 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  34.19 
 
 		 310 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  34.41 
 
 		 309 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  33.65 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3579  homoserine kinase  33.64 
 
 		 331 aa  159  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1306  homoserine kinase  37.73 
 
 		 302 aa  157  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.460055  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1213  homoserine kinase  33.02 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241016  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0658  homoserine kinase  36.63 
 
 		 301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.411206  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  32.28 
 
 		 309 aa  155  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3310  homoserine kinase  39.8 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1378  homoserine kinase  36.26 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  33.44 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  34.46 
 
 		 300 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1298  homoserine kinase  35.53 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.801618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00815  homoserine kinase  41.47 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.500035  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0833  homoserine kinase  31.76 
 
 		 312 aa  145  9e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2555  homoserine kinase  31.96 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4290  homoserine kinase  31.96 
 
 		 328 aa  142  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  31.05 
 
 		 303 aa  139  7e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  32.17 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2392  homoserine kinase  38.46 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.6073 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1942  homoserine kinase  30.82 
 
 		 318 aa  132  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17619  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  31.02 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  31.83 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  31.83 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  31.13 
 
 		 302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  29.37 
 
 		 311 aa  129  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  31.53 
 
 		 315 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  30.98 
 
 		 315 aa  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  31.44 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03327  homoserine kinase  31.01 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1276  homoserine kinase  34.07 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  32.45 
 
 		 296 aa  125  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  31.63 
 
 		 305 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3414  homoserine kinase  32.04 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  32.06 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1067  homoserine kinase  32.79 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  32.11 
 
 		 311 aa  122  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  29.3 
 
 		 297 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  30.03 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  31.31 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1210  homoserine kinase  31.39 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1139  homoserine kinase  31.17 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  30.41 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  30.25 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  29.58 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3085  homoserine kinase  30.38 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479885  hitchhiker  0.00212807 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1140  homoserine kinase  31.17 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0308198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  30.07 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  30.98 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0906  homoserine kinase  29.71 
 
 		 314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0672  homoserine kinase  31.01 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000904789 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1176  homoserine kinase  30.1 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1272  homoserine kinase  30.38 
 
 		 320 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140701  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  29.63 
 
 		 307 aa  115  8.999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1271  homoserine kinase  29.83 
 
 		 311 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0252184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>