255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07415 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_07415  homoserine kinase  100 
 
 		 308 aa  632  1e-180  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  50.49 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2574  homoserine kinase  52.46 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  46.71 
 
 		 311 aa  279  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3803  homoserine kinase  45.34 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3151  homoserine kinase  46.05 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5430  homoserine kinase  47.4 
 
 		 311 aa  249  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2545  homoserine kinase  43.53 
 
 		 320 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0629954  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1986  homoserine kinase  43.85 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2333  homoserine kinase  44.79 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0296  homoserine kinase  43.95 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0261  homoserine kinase  43.95 
 
 		 320 aa  230  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.836867  normal  0.0420212 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2706  homoserine kinase  42.9 
 
 		 320 aa  223  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0139  homoserine kinase  43.63 
 
 		 320 aa  221  9e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0041  homoserine kinase  38.21 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1262  homoserine kinase  32.9 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1306  homoserine kinase  41.26 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.460055  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1298  homoserine kinase  41.04 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.801618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1378  homoserine kinase  40.67 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0658  homoserine kinase  40.67 
 
 		 301 aa  175  8e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.411206  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0833  homoserine kinase  38.63 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1357  homoserine kinase  34.95 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1424  homoserine kinase  34.95 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1097  homoserine kinase  35.79 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3579  homoserine kinase  31.86 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  32.14 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  32.14 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  32.14 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  31.17 
 
 		 309 aa  155  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1251  homoserine kinase  35.1 
 
 		 296 aa  150  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  30.74 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  30.74 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  30.74 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  30.74 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  30.74 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  30.74 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  30.74 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  30.74 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  30.74 
 
 		 310 aa  149  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03327  homoserine kinase  36.52 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1213  homoserine kinase  33.68 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241016  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3667  homoserine kinase  29.41 
 
 		 309 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.478541  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4290  homoserine kinase  32.15 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  29.08 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0058  homoserine kinase  34.36 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.188045  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  30.19 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1644  homoserine kinase  33.78 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00940  homoserine kinase  31.05 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004456  homoserine kinase  29.77 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0534  homoserine kinase  30.19 
 
 		 309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  29.87 
 
 		 309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  29.87 
 
 		 309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  29.87 
 
 		 309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  29.87 
 
 		 309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  29.87 
 
 		 309 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1750  homoserine kinase  34.32 
 
 		 304 aa  139  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1731 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  28.57 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2555  homoserine kinase  31.72 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  31.02 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3310  homoserine kinase  33.22 
 
 		 293 aa  132  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2392  homoserine kinase  36.77 
 
 		 326 aa  132  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.6073 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2302  homoserine kinase  33.45 
 
 		 293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.591143  normal  0.310319 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0672  homoserine kinase  30.77 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000904789 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  30.89 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  30.9 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  28.66 
 
 		 303 aa  126  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  30.9 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  31.19 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0261  homoserine kinase  35.56 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000622844 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  29.08 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  28.67 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1271  homoserine kinase  29.68 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1942  homoserine kinase  29.13 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17619  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  30.26 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00815  homoserine kinase  36.91 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.500035  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  32.58 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  30.42 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  31.68 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  32.03 
 
 		 303 aa  116  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  28.57 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  31.32 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  30.96 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  30.12 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1176  homoserine kinase  29.62 
 
 		 312 aa  113  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  28.71 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  29.49 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0899  homoserine kinase  30.18 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  29.75 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000301538  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  28.21 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1080  homoserine kinase  30 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.708816  normal  0.284936 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  29.03 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1139  homoserine kinase  29.81 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1140  homoserine kinase  29.81 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0308198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16080  homoserine kinase  29.77 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.222088  hitchhiker  0.000000158758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1272  homoserine kinase  30.41 
 
 		 320 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140701  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1067  homoserine kinase  29.35 
 
 		 311 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  29.55 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3085  homoserine kinase  30 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479885  hitchhiker  0.00212807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  29.97 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1210  homoserine kinase  29.49 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>