260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1378 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1378  homoserine kinase  100 
 
 
301 aa  604  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0658  homoserine kinase  98.34 
 
 
301 aa  592  1e-168  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.411206  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1298  homoserine kinase  95.35 
 
 
301 aa  558  1e-158  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.801618  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1306  homoserine kinase  85.1 
 
 
302 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.460055  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0833  homoserine kinase  73.62 
 
 
312 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0058  homoserine kinase  41.55 
 
 
291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.188045  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1644  homoserine kinase  41.33 
 
 
291 aa  187  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  38.6 
 
 
309 aa  185  8e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2302  homoserine kinase  40.92 
 
 
293 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.591143  normal  0.310319 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1251  homoserine kinase  40.2 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0041  homoserine kinase  40.59 
 
 
307 aa  170  3e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3310  homoserine kinase  38 
 
 
293 aa  169  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07415  homoserine kinase  40.67 
 
 
308 aa  169  6e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  35.87 
 
 
311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1262  homoserine kinase  35.79 
 
 
325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3151  homoserine kinase  36.26 
 
 
309 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3803  homoserine kinase  38.32 
 
 
311 aa  155  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1986  homoserine kinase  37.14 
 
 
320 aa  149  6e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2545  homoserine kinase  34.33 
 
 
320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0629954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2574  homoserine kinase  39.68 
 
 
306 aa  146  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5430  homoserine kinase  38.1 
 
 
311 aa  142  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0261  homoserine kinase  35.96 
 
 
308 aa  142  7e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000622844 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2333  homoserine kinase  34.63 
 
 
320 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2706  homoserine kinase  34.68 
 
 
320 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  33.45 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0672  homoserine kinase  30.67 
 
 
311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000904789 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0296  homoserine kinase  35.97 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0261  homoserine kinase  32.48 
 
 
320 aa  129  8.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.836867  normal  0.0420212 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  31.1 
 
 
301 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0139  homoserine kinase  33.57 
 
 
320 aa  125  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2392  homoserine kinase  36.65 
 
 
326 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.6073 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  34.67 
 
 
308 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  31.76 
 
 
307 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  31.6 
 
 
300 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1213  homoserine kinase  31.27 
 
 
314 aa  123  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241016  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1357  homoserine kinase  30.68 
 
 
322 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1424  homoserine kinase  30.68 
 
 
322 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  34.03 
 
 
311 aa  119  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1074  homoserine kinase  35.19 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  34.07 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  30.72 
 
 
315 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  30.72 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  30.29 
 
 
310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  30.29 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  30.29 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  30.29 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0899  homoserine kinase  30.03 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  30.29 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  29.01 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  30.29 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  30.29 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  30.29 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  30.29 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  28.12 
 
 
305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  30.21 
 
 
303 aa  112  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  31.12 
 
 
302 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  32.47 
 
 
297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  29.86 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  29.86 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  29.86 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  29.86 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  33.57 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1418  homoserine kinase  30.48 
 
 
304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.011674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  29.86 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1391  homoserine kinase  30.48 
 
 
304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00775199  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  28.36 
 
 
309 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0179  homoserine kinase  35.07 
 
 
311 aa  109  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0944739  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  32.85 
 
 
314 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000301538  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  29.25 
 
 
304 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1271  homoserine kinase  32.1 
 
 
311 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0534  homoserine kinase  29.04 
 
 
309 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  30.04 
 
 
309 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  29.79 
 
 
315 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  28.04 
 
 
309 aa  105  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  28.04 
 
 
309 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  28.04 
 
 
309 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  31.7 
 
 
302 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  29.26 
 
 
309 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2555  homoserine kinase  30.25 
 
 
318 aa  104  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  29.89 
 
 
309 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  26.3 
 
 
315 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3124  homoserine kinase  30.77 
 
 
310 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1281  homoserine kinase  29.84 
 
 
296 aa  103  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.045186  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0376  homoserine kinase  30.22 
 
 
296 aa  103  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19320  homoserine kinase  31.23 
 
 
304 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3667  homoserine kinase  28.89 
 
 
309 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.478541  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  29.47 
 
 
315 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  26.65 
 
 
316 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  29.82 
 
 
315 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14830  homoserine kinase  28.43 
 
 
297 aa  102  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17524  normal  0.116843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4151  homoserine kinase  28.28 
 
 
321 aa  102  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  26.55 
 
 
315 aa  101  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3936  homoserine kinase  29.26 
 
 
316 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3579  homoserine kinase  29.08 
 
 
331 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0785  homoserine kinase  30.53 
 
 
292 aa  101  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1080  homoserine kinase  30.15 
 
 
316 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.708816  normal  0.284936 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  32 
 
 
303 aa  101  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1942  homoserine kinase  29.33 
 
 
318 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2894  homoserine kinase  28.14 
 
 
304 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.710654  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1176  homoserine kinase  30.63 
 
 
312 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>