278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2555 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2555  homoserine kinase  100 
 
 		 318 aa  659    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004456  homoserine kinase  83.02 
 
 		 323 aa  566  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00940  homoserine kinase  83.33 
 
 		 323 aa  566  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1942  homoserine kinase  83.02 
 
 		 318 aa  546  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17619  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  69.65 
 
 		 309 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  67.73 
 
 		 309 aa  451  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0534  homoserine kinase  68.69 
 
 		 309 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  68.49 
 
 		 310 aa  448  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  68.49 
 
 		 310 aa  448  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  68.49 
 
 		 310 aa  448  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3667  homoserine kinase  69.01 
 
 		 309 aa  449  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.478541  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  68.49 
 
 		 310 aa  448  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  68.49 
 
 		 310 aa  448  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  68.49 
 
 		 310 aa  448  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  68.81 
 
 		 310 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  68.17 
 
 		 310 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  67.85 
 
 		 310 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  65.81 
 
 		 309 aa  442  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  67.41 
 
 		 309 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  67.41 
 
 		 309 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  65.81 
 
 		 309 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  67.41 
 
 		 309 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  65.81 
 
 		 309 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  67.09 
 
 		 309 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  67.41 
 
 		 309 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  67.09 
 
 		 309 aa  438  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  66.77 
 
 		 309 aa  438  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1213  homoserine kinase  61.69 
 
 		 314 aa  422  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241016  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1276  homoserine kinase  58.49 
 
 		 318 aa  388  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3579  homoserine kinase  53.05 
 
 		 331 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4290  homoserine kinase  54.6 
 
 		 328 aa  354  1e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1228  homoserine kinase  54.57 
 
 		 320 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0499672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1272  homoserine kinase  54.57 
 
 		 320 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140701  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1067  homoserine kinase  55.77 
 
 		 311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1305  homoserine kinase  53.94 
 
 		 320 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1176  homoserine kinase  52.87 
 
 		 312 aa  339  4e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2734  homoserine kinase  54.26 
 
 		 320 aa  338  8e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3085  homoserine kinase  54.09 
 
 		 321 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479885  hitchhiker  0.00212807 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0906  homoserine kinase  53.63 
 
 		 314 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3414  homoserine kinase  53.85 
 
 		 312 aa  332  4e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1210  homoserine kinase  53.21 
 
 		 312 aa  330  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2905  homoserine kinase  52.41 
 
 		 319 aa  329  3e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1139  homoserine kinase  52.56 
 
 		 312 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1140  homoserine kinase  52.56 
 
 		 312 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0308198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1271  homoserine kinase  50.8 
 
 		 311 aa  324  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1080  homoserine kinase  51.92 
 
 		 316 aa  324  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.708816  normal  0.284936 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03327  homoserine kinase  51.46 
 
 		 315 aa  323  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2739  homoserine kinase  50.93 
 
 		 328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11354  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  33.85 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  32.7 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3803  homoserine kinase  34.81 
 
 		 311 aa  149  8e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3151  homoserine kinase  31.96 
 
 		 309 aa  135  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  31.23 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  30.6 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0296  homoserine kinase  33.75 
 
 		 320 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  31.74 
 
 		 306 aa  129  9.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2545  homoserine kinase  31.53 
 
 		 320 aa  126  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0629954  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07415  homoserine kinase  31.72 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  29.1 
 
 		 315 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  30.25 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  30.61 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1986  homoserine kinase  31.21 
 
 		 320 aa  122  7e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0261  homoserine kinase  32.44 
 
 		 320 aa  122  8e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.836867  normal  0.0420212 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0899  homoserine kinase  31.38 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  28.8 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  29.38 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  28.08 
 
 		 297 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  31.06 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  29.83 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1262  homoserine kinase  32.13 
 
 		 325 aa  119  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  28.25 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  30.04 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  30.56 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  32.88 
 
 		 315 aa  115  8.999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  32.65 
 
 		 315 aa  115  8.999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2333  homoserine kinase  31.65 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0139  homoserine kinase  31.35 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1357  homoserine kinase  34.19 
 
 		 322 aa  113  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1424  homoserine kinase  34.19 
 
 		 322 aa  113  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  29.14 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  30.45 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  30.74 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2302  homoserine kinase  31.77 
 
 		 293 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.591143  normal  0.310319 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  28.98 
 
 		 303 aa  109  6e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  30.04 
 
 		 315 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  29.41 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  28.26 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  29.18 
 
 		 303 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2706  homoserine kinase  29.73 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  29.1 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0041  homoserine kinase  28.14 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1281  homoserine kinase  29.28 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.045186  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0596  homoserine kinase  26.58 
 
 		 293 aa  106  6e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  31.67 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5430  homoserine kinase  31.23 
 
 		 311 aa  105  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  30.48 
 
 		 316 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1251  homoserine kinase  30.48 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  26.8 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0058  homoserine kinase  31.75 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.188045  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2574  homoserine kinase  30.38 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>