239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2392 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2392  homoserine kinase  100 
 
 		 326 aa  626  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.6073 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  38.1 
 
 		 309 aa  206  5e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  37.91 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3151  homoserine kinase  38.46 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  36.08 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07415  homoserine kinase  36.77 
 
 		 308 aa  178  9e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3803  homoserine kinase  39.23 
 
 		 311 aa  178  9e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  38.69 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  38.03 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  37.5 
 
 		 316 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  40.47 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  34.82 
 
 		 315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1262  homoserine kinase  41.67 
 
 		 325 aa  163  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2545  homoserine kinase  35.71 
 
 		 320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0629954  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1298  homoserine kinase  37.41 
 
 		 301 aa  162  9e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.801618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  34.5 
 
 		 302 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  34.38 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  34.07 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  33.23 
 
 		 311 aa  159  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1986  homoserine kinase  36.39 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0658  homoserine kinase  37.41 
 
 		 301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.411206  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0296  homoserine kinase  35.29 
 
 		 320 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  35.08 
 
 		 315 aa  156  6e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  35.08 
 
 		 315 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  36.79 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2706  homoserine kinase  35.74 
 
 		 320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2333  homoserine kinase  35.74 
 
 		 320 aa  153  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  33.88 
 
 		 303 aa  153  5e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  32.53 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1378  homoserine kinase  36.71 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0139  homoserine kinase  37.01 
 
 		 320 aa  150  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  34.54 
 
 		 307 aa  150  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2574  homoserine kinase  37.62 
 
 		 306 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0833  homoserine kinase  34.69 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  35.05 
 
 		 309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1306  homoserine kinase  35.31 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.460055  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0534  homoserine kinase  34.62 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00940  homoserine kinase  33.99 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004456  homoserine kinase  33.44 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0261  homoserine kinase  34.32 
 
 		 320 aa  143  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.836867  normal  0.0420212 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  33.8 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  33.8 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3667  homoserine kinase  33.57 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.478541  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  33.57 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  34.31 
 
 		 306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  34.6 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  37.05 
 
 		 304 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  34.6 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  34.26 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  34.26 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  34.26 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10551  homoserine kinase  33.55 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  34.26 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  34.26 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  34.84 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  34.26 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  34.26 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  34.62 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3579  homoserine kinase  33.01 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  34.62 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0041  homoserine kinase  32.38 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  34.62 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1479  homoserine kinase  34.35 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  33.44 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  34.36 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  33.76 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5430  homoserine kinase  36.94 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  34.36 
 
 		 309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  34.36 
 
 		 309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  34.36 
 
 		 309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  34.36 
 
 		 309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  33.11 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  32.45 
 
 		 304 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  34.2 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1357  homoserine kinase  37.81 
 
 		 322 aa  134  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1213  homoserine kinase  32.53 
 
 		 314 aa  133  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241016  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1424  homoserine kinase  37.81 
 
 		 322 aa  134  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  36.31 
 
 		 314 aa  133  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000301538  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  33.7 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  32.04 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1251  homoserine kinase  37.18 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0058  homoserine kinase  37.79 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.188045  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1074  homoserine kinase  40.73 
 
 		 313 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3124  homoserine kinase  37.1 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  31.91 
 
 		 303 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1942  homoserine kinase  34.54 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17619  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1097  homoserine kinase  38.89 
 
 		 314 aa  124  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2555  homoserine kinase  32.01 
 
 		 318 aa  122  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4290  homoserine kinase  31.88 
 
 		 328 aa  122  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  28.32 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1750  homoserine kinase  37.59 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1731 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3310  homoserine kinase  37.83 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0593  homoserine kinase  30.99 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1271  homoserine kinase  32.68 
 
 		 311 aa  119  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2050  homoserine kinase  36.92 
 
 		 300 aa  119  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.189135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0261  homoserine kinase  33.22 
 
 		 308 aa  119  9e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000622844 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03327  homoserine kinase  31.7 
 
 		 315 aa  119  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1644  homoserine kinase  36.82 
 
 		 291 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1176  homoserine kinase  31.21 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1201  homoserine kinase  37.24 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>