235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2545 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2545  homoserine kinase  100 
 
 
320 aa  648    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0629954  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2333  homoserine kinase  85.94 
 
 
320 aa  536  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2706  homoserine kinase  82.5 
 
 
320 aa  518  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0296  homoserine kinase  80.94 
 
 
320 aa  514  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1986  homoserine kinase  80.94 
 
 
320 aa  511  1e-144  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0261  homoserine kinase  80.62 
 
 
320 aa  493  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.836867  normal  0.0420212 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0139  homoserine kinase  77.19 
 
 
320 aa  479  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  52.2 
 
 
309 aa  342  4e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  52.65 
 
 
311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3151  homoserine kinase  53.12 
 
 
309 aa  300  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3803  homoserine kinase  46.39 
 
 
311 aa  276  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2574  homoserine kinase  48.58 
 
 
306 aa  255  9e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07415  homoserine kinase  43.53 
 
 
308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5430  homoserine kinase  47.5 
 
 
311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1424  homoserine kinase  40.69 
 
 
322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1357  homoserine kinase  40.69 
 
 
322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0041  homoserine kinase  36.21 
 
 
307 aa  167  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1262  homoserine kinase  35.65 
 
 
325 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3579  homoserine kinase  31.89 
 
 
331 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  33.54 
 
 
309 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  33.54 
 
 
309 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  33.54 
 
 
309 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004456  homoserine kinase  31.85 
 
 
323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00940  homoserine kinase  31.78 
 
 
323 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1750  homoserine kinase  39.68 
 
 
304 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.1731 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1306  homoserine kinase  34.67 
 
 
302 aa  149  5e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.460055  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  32.78 
 
 
309 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  32.19 
 
 
309 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0658  homoserine kinase  34.33 
 
 
301 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.411206  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1378  homoserine kinase  34 
 
 
301 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  32.45 
 
 
309 aa  142  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1213  homoserine kinase  31.19 
 
 
314 aa  142  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241016  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03327  homoserine kinase  35.06 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1298  homoserine kinase  32.27 
 
 
301 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.801618  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0534  homoserine kinase  30.64 
 
 
309 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3667  homoserine kinase  32.12 
 
 
309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.478541  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0833  homoserine kinase  33.11 
 
 
312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1097  homoserine kinase  37.28 
 
 
314 aa  139  8.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  30.28 
 
 
310 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  30.28 
 
 
310 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  30.28 
 
 
310 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  30.28 
 
 
309 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  29.97 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  29.97 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  29.97 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  29.97 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1251  homoserine kinase  37.04 
 
 
296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  29.97 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  29.97 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0058  homoserine kinase  37.37 
 
 
291 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.188045  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  31.29 
 
 
309 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  31.29 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  31.29 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  31.29 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  31.29 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2302  homoserine kinase  38.05 
 
 
293 aa  132  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.591143  normal  0.310319 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2555  homoserine kinase  31.53 
 
 
318 aa  132  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0906  homoserine kinase  34.11 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1276  homoserine kinase  32.61 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  31.99 
 
 
315 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1644  homoserine kinase  35.87 
 
 
291 aa  125  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1271  homoserine kinase  33.55 
 
 
311 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  30.77 
 
 
316 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1942  homoserine kinase  30.06 
 
 
318 aa  124  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17619  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  30.41 
 
 
303 aa  123  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3310  homoserine kinase  36.7 
 
 
293 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  32.41 
 
 
302 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00815  homoserine kinase  38.59 
 
 
294 aa  122  8e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.500035  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1176  homoserine kinase  31.85 
 
 
312 aa  122  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4290  homoserine kinase  30.92 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  31.37 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  30.7 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2905  homoserine kinase  31.33 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  30.56 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  30.98 
 
 
315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  30.65 
 
 
301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2392  homoserine kinase  36.07 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.6073 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1067  homoserine kinase  31.31 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1139  homoserine kinase  32.44 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3414  homoserine kinase  31.76 
 
 
312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  34.25 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1140  homoserine kinase  32.44 
 
 
312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0308198  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1210  homoserine kinase  32.11 
 
 
312 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  31.14 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1305  homoserine kinase  31.91 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1078  homoserine kinase  35.03 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323188  normal  0.147957 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1272  homoserine kinase  31.91 
 
 
320 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140701  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0376  homoserine kinase  33.65 
 
 
296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  30.45 
 
 
305 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0672  homoserine kinase  31.54 
 
 
311 aa  112  6e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000904789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  30.09 
 
 
305 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  31.08 
 
 
317 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1228  homoserine kinase  30.59 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0499672  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2734  homoserine kinase  32.25 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3085  homoserine kinase  31.25 
 
 
321 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479885  hitchhiker  0.00212807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  28.91 
 
 
300 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185248 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0179  homoserine kinase  30.93 
 
 
311 aa  107  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0944739  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  30.2 
 
 
315 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0054  homoserine kinase  34.94 
 
 
298 aa  105  8e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  29.87 
 
 
315 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>