237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2706 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2706  homoserine kinase  100 
 
 		 320 aa  650    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2545  homoserine kinase  82.5 
 
 		 320 aa  529  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0629954  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1986  homoserine kinase  83.75 
 
 		 320 aa  526  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2333  homoserine kinase  85 
 
 		 320 aa  526  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0139  homoserine kinase  81.88 
 
 		 320 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0296  homoserine kinase  80 
 
 		 320 aa  503  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0261  homoserine kinase  80.31 
 
 		 320 aa  494  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.836867  normal  0.0420212 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  52.2 
 
 		 309 aa  337  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  51.56 
 
 		 311 aa  325  7e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3151  homoserine kinase  53.44 
 
 		 309 aa  297  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3803  homoserine kinase  46.88 
 
 		 311 aa  280  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2574  homoserine kinase  49.84 
 
 		 306 aa  261  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5430  homoserine kinase  45.6 
 
 		 311 aa  228  9e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07415  homoserine kinase  42.9 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1424  homoserine kinase  40.38 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1357  homoserine kinase  40.38 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0041  homoserine kinase  36.51 
 
 		 307 aa  166  5e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1262  homoserine kinase  35.96 
 
 		 325 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3579  homoserine kinase  32.51 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  33.85 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  33.85 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  33.85 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1750  homoserine kinase  39.05 
 
 		 304 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  32.81 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  33 
 
 		 309 aa  149  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  32.31 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0658  homoserine kinase  34.68 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.411206  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1378  homoserine kinase  34.68 
 
 		 301 aa  146  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  32.19 
 
 		 309 aa  145  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0534  homoserine kinase  32.51 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1306  homoserine kinase  33.67 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.460055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3667  homoserine kinase  32.19 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.478541  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  31.25 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  31.25 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1213  homoserine kinase  32.81 
 
 		 314 aa  142  9e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241016  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  31.25 
 
 		 310 aa  142  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  31.25 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  31.25 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  31.25 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  31.25 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  31.25 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  31.25 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0833  homoserine kinase  33.77 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1251  homoserine kinase  37.79 
 
 		 296 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004456  homoserine kinase  29.69 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1298  homoserine kinase  32.59 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.801618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  31.56 
 
 		 309 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  31.56 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  31.56 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  31.56 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03327  homoserine kinase  34.2 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  31.56 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0058  homoserine kinase  37.04 
 
 		 291 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.188045  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1276  homoserine kinase  35.47 
 
 		 318 aa  135  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00940  homoserine kinase  29.1 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1644  homoserine kinase  36.72 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1097  homoserine kinase  35.34 
 
 		 314 aa  132  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2302  homoserine kinase  38.11 
 
 		 293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.591143  normal  0.310319 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4290  homoserine kinase  31.58 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  32.26 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1271  homoserine kinase  34.3 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1176  homoserine kinase  33.96 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1942  homoserine kinase  29.97 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17619  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0906  homoserine kinase  32.3 
 
 		 314 aa  122  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2555  homoserine kinase  29.73 
 
 		 318 aa  122  8e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3310  homoserine kinase  34.3 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  31.88 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00815  homoserine kinase  38.31 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.500035  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  30.77 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3414  homoserine kinase  33.33 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  30.77 
 
 		 305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  32.11 
 
 		 315 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1139  homoserine kinase  33.33 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2905  homoserine kinase  32.34 
 
 		 319 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  32.71 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1140  homoserine kinase  33.33 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0308198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2392  homoserine kinase  35.74 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.6073 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1272  homoserine kinase  34.67 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140701  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1210  homoserine kinase  32.99 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  33.22 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  32.2 
 
 		 315 aa  115  8.999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1305  homoserine kinase  34.33 
 
 		 320 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  33.79 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  31.96 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  30.79 
 
 		 315 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  29.21 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  29.41 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1228  homoserine kinase  34 
 
 		 320 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0499672  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0672  homoserine kinase  29.75 
 
 		 311 aa  112  6e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000904789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1794  homoserine kinase  37.8 
 
 		 284 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  32.21 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3085  homoserine kinase  33.11 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479885  hitchhiker  0.00212807 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  30.48 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  30.79 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2734  homoserine kinase  34.72 
 
 		 320 aa  109  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1067  homoserine kinase  32.75 
 
 		 311 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  29.11 
 
 		 300 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  28.53 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0376  homoserine kinase  32.38 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  32.2 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>