More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2739 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2739  homoserine kinase  100 
 
 		 328 aa  672    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11354  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3085  homoserine kinase  71.12 
 
 		 321 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479885  hitchhiker  0.00212807 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3414  homoserine kinase  71.96 
 
 		 312 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2734  homoserine kinase  71.73 
 
 		 320 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1228  homoserine kinase  71.43 
 
 		 320 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0499672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1272  homoserine kinase  70.52 
 
 		 320 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140701  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1305  homoserine kinase  70.82 
 
 		 320 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1210  homoserine kinase  71.03 
 
 		 312 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1080  homoserine kinase  71.25 
 
 		 316 aa  447  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.708816  normal  0.284936 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1176  homoserine kinase  70.44 
 
 		 312 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1139  homoserine kinase  70.72 
 
 		 312 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2905  homoserine kinase  70.94 
 
 		 319 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1140  homoserine kinase  70.72 
 
 		 312 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0308198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0906  homoserine kinase  70.09 
 
 		 314 aa  435  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1271  homoserine kinase  67.19 
 
 		 311 aa  425  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1067  homoserine kinase  66.88 
 
 		 311 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0534  homoserine kinase  51.56 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  51.26 
 
 		 309 aa  349  5e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  50.94 
 
 		 309 aa  341  9e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  50 
 
 		 310 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  50 
 
 		 310 aa  339  4e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  50 
 
 		 310 aa  339  4e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  50 
 
 		 310 aa  339  4e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  50 
 
 		 310 aa  339  4e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  50 
 
 		 310 aa  339  4e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  50 
 
 		 310 aa  339  4e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  50 
 
 		 310 aa  339  4e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  50 
 
 		 310 aa  339  4e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3667  homoserine kinase  50.62 
 
 		 309 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.478541  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  50.31 
 
 		 309 aa  338  9e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  50 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  50 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  50.31 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  50 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  50.31 
 
 		 309 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  50.31 
 
 		 309 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  50.31 
 
 		 309 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  50.31 
 
 		 309 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004456  homoserine kinase  50.46 
 
 		 323 aa  332  4e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2555  homoserine kinase  50.93 
 
 		 318 aa  332  4e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1942  homoserine kinase  50 
 
 		 318 aa  332  7.000000000000001e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17619  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00940  homoserine kinase  50.15 
 
 		 323 aa  331  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1213  homoserine kinase  48.14 
 
 		 314 aa  330  2e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241016  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  49.06 
 
 		 309 aa  328  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1276  homoserine kinase  53.4 
 
 		 318 aa  318  6e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3579  homoserine kinase  46.93 
 
 		 331 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03327  homoserine kinase  50 
 
 		 315 aa  293  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4290  homoserine kinase  45.12 
 
 		 328 aa  288  7e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  28.7 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  30.25 
 
 		 305 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  29.94 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  31.78 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  30.03 
 
 		 311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1986  homoserine kinase  31.6 
 
 		 320 aa  113  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  32.18 
 
 		 304 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  32.39 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  27.86 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3803  homoserine kinase  31.42 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2545  homoserine kinase  31.6 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0629954  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  32.08 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0261  homoserine kinase  31.91 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.836867  normal  0.0420212 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  27.19 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  28.33 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  31.8 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  28.47 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0041  homoserine kinase  28.07 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3151  homoserine kinase  29.45 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1357  homoserine kinase  31.41 
 
 		 322 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1424  homoserine kinase  31.41 
 
 		 322 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1262  homoserine kinase  28.66 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  30.38 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0296  homoserine kinase  30.93 
 
 		 320 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  28.85 
 
 		 316 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  26.55 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  29.72 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  29.19 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  29.45 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  29.35 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  29.14 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  30.29 
 
 		 315 aa  96.3  6e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  29.31 
 
 		 315 aa  96.3  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2706  homoserine kinase  32.63 
 
 		 320 aa  96.3  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0139  homoserine kinase  31.21 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19320  homoserine kinase  31.01 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16080  homoserine kinase  25.62 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.222088  hitchhiker  0.000000158758 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85224  homoserine kinase  26.4 
 
 		 353 aa  94.4  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.481244  normal  0.37391 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5430  homoserine kinase  30.34 
 
 		 311 aa  93.6  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2333  homoserine kinase  31.99 
 
 		 320 aa  93.2  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1251  homoserine kinase  30.04 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  28.72 
 
 		 303 aa  92  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  29.35 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  29.11 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1750  homoserine kinase  29.6 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1731 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0899  homoserine kinase  29.37 
 
 		 306 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  27.36 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1097  homoserine kinase  30 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1391  homoserine kinase  30.04 
 
 		 304 aa  89.7  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00775199  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  28.77 
 
 		 317 aa  89.7  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1418  homoserine kinase  30.04 
 
 		 304 aa  89.7  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.011674  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  27.24 
 
 		 304 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>