More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2187 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  46.82 
 
 		 893 aa  754    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  46.44 
 
 		 876 aa  771    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  43.88 
 
 		 882 aa  709    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  97.71 
 
 		 874 aa  1718    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  100 
 
 		 874 aa  1750    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  43.92 
 
 		 887 aa  698    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  38.12 
 
 		 881 aa  617  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  39.6 
 
 		 885 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  38.6 
 
 		 894 aa  603  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  37.13 
 
 		 894 aa  574  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  38.42 
 
 		 879 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  34.95 
 
 		 906 aa  551  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  37.53 
 
 		 877 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  37.41 
 
 		 877 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  34.92 
 
 		 895 aa  541  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  37.11 
 
 		 901 aa  541  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  35.67 
 
 		 918 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  38.06 
 
 		 902 aa  536  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  35.45 
 
 		 910 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  37.46 
 
 		 900 aa  533  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  35.27 
 
 		 914 aa  530  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  36.55 
 
 		 856 aa  528  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  33.22 
 
 		 908 aa  523  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  35.44 
 
 		 939 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  36.24 
 
 		 856 aa  493  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  35.09 
 
 		 861 aa  490  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  34.23 
 
 		 875 aa  491  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  34.26 
 
 		 856 aa  490  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  35.09 
 
 		 861 aa  490  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  34.75 
 
 		 858 aa  489  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  33.77 
 
 		 879 aa  489  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  34.42 
 
 		 857 aa  487  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  34.76 
 
 		 865 aa  487  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  34.43 
 
 		 855 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  34.18 
 
 		 856 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  32.71 
 
 		 890 aa  472  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  36.22 
 
 		 855 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  36.22 
 
 		 855 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  34.39 
 
 		 861 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  34.13 
 
 		 871 aa  461  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  36.1 
 
 		 855 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  33.53 
 
 		 896 aa  446  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  33.88 
 
 		 862 aa  439  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  31.53 
 
 		 878 aa  419  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  32.25 
 
 		 872 aa  415  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  30.55 
 
 		 886 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  30.55 
 
 		 886 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  30.7 
 
 		 883 aa  398  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  32.1 
 
 		 755 aa  360  8e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  31.63 
 
 		 751 aa  357  5.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  30.68 
 
 		 727 aa  352  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  29.83 
 
 		 723 aa  345  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  30.06 
 
 		 741 aa  342  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  29.78 
 
 		 722 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  32.07 
 
 		 730 aa  337  5e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  29.33 
 
 		 723 aa  337  7e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  29.87 
 
 		 730 aa  336  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  30.9 
 
 		 746 aa  334  4e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  29.17 
 
 		 727 aa  333  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  29.04 
 
 		 743 aa  328  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  30.07 
 
 		 744 aa  322  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  30.62 
 
 		 748 aa  314  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2756  Mur ligase family protein  34.69 
 
 		 560 aa  233  9e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  25.17 
 
 		 741 aa  211  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000448446  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  30.89 
 
 		 538 aa  203  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  31.48 
 
 		 622 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  28.15 
 
 		 637 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  31.44 
 
 		 584 aa  195  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  30.44 
 
 		 636 aa  187  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  30.92 
 
 		 646 aa  171  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  26.64 
 
 		 664 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  26.5 
 
 		 573 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4828  Mur ligase middle domain protein  32.76 
 
 		 576 aa  155  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  28.5 
 
 		 647 aa  154  8e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  30.39 
 
 		 597 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.86 
 
 		 778 aa  142  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  27.95 
 
 		 593 aa  141  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  33.46 
 
 		 328 aa  140  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.5 
 
 		 778 aa  139  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1989  Mur ligase middle domain-containing protein  26.48 
 
 		 427 aa  137  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2734  hypothetical protein  29.93 
 
 		 340 aa  135  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2607  hypothetical protein  30.23 
 
 		 340 aa  135  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3641  glutathione synthase  28.19 
 
 		 595 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  29.3 
 
 		 585 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  28.08 
 
 		 571 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0859  glutathione synthase  29.62 
 
 		 612 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2245  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  25.47 
 
 		 584 aa  129  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.560299  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1988  GCN5-related N-acetyltransferase  25.47 
 
 		 562 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.42 
 
 		 757 aa  127  8.000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  28.57 
 
 		 569 aa  127  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  26.75 
 
 		 584 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.96 
 
 		 755 aa  126  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19360  GNAT family acetyltransferase  29.3 
 
 		 585 aa  126  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371953  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0096  hypothetical protein  27.6 
 
 		 441 aa  125  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.284212  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.58 
 
 		 755 aa  124  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  28.9 
 
 		 578 aa  124  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0815  glutathione synthase  27.38 
 
 		 572 aa  121  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 		 588 aa  120  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13520  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  30.57 
 
 		 725 aa  120  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0923131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  26.51 
 
 		 593 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>