149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1624 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1624  calcium/proton exchanger  100 
 
 
348 aa  673    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000062591  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1366  calcium/proton exchanger  98.56 
 
 
348 aa  668    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.609235  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3705  H+/Ca2+ exchanging protein  52.19 
 
 
354 aa  348  6e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.965046 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3557  calcium/proton antiporter, CaCA family  50.28 
 
 
365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.494626 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2549  calcium/proton antiporter, CaCA family  50.28 
 
 
365 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0142  calcium/proton exchanger  51.45 
 
 
360 aa  322  6e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3626  calcium/cation antiporter  52.66 
 
 
372 aa  315  5e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.319673 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1369  calcium/proton antiporter, CaCA family  49.29 
 
 
354 aa  315  9e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2705  calcium/cation antiporter  46.07 
 
 
370 aa  313  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000150317  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4558  calcium/proton exchanger  50.87 
 
 
363 aa  311  7.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1655  calcium/proton antiporter, CaCA family  48.83 
 
 
379 aa  305  7e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2439  CaCA family calcium/proton antiporter  49.3 
 
 
364 aa  299  4e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.219507  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3001  calcium/proton antiporter, CaCA family  45.14 
 
 
358 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0393  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  46.78 
 
 
354 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0535  calcium/proton exchanger  47.08 
 
 
354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0397  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  46.78 
 
 
354 aa  286  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0535  calcium/proton exchanger  47.08 
 
 
351 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0465  calcium/proton exchanger  46.78 
 
 
351 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0484  calcium/proton exchanger  47.08 
 
 
351 aa  286  5e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0406  calcium/proton exchanger  46.78 
 
 
354 aa  285  7e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0419  calcium/proton exchanger  46.78 
 
 
354 aa  285  7e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0405  calcium/cation antiporter  46.9 
 
 
351 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0422  calcium/proton antiporter, CaCA family  46.8 
 
 
350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00187889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5035  calcium/proton antiporter, CaCA family  49.71 
 
 
367 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3782  calcium/cation antiporter  45.63 
 
 
374 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.133642 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1302  calcium/proton antiporter, CaCA family  47.59 
 
 
350 aa  279  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0399  calcium/cation antiporter  47.08 
 
 
351 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67118  Ca2+/H+ antiporter  40.16 
 
 
416 aa  277  2e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.112466  normal  0.866268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0927  calcium/proton antiporter, CaCA family  47.14 
 
 
363 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4839  calcium/proton exchanger  46.96 
 
 
351 aa  276  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21390  calcium/proton antiporter, CaCA family  43.59 
 
 
349 aa  270  4e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1870  calcium/proton antiporter, CaCA family  43.94 
 
 
351 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0023  calcium/proton exchanger  45.8 
 
 
354 aa  261  8.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.662707 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0486  calcium/proton antiporter, CaCA family  47.99 
 
 
358 aa  255  8e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.18293  normal  0.526357 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00471  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  39.12 
 
 
434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.463477  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0904  calcium/proton antiporter, CaCA family  47.32 
 
 
356 aa  249  4e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0458439  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0894  calcium/proton exchanger  42.15 
 
 
367 aa  246  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1907  calcium/proton exchanger  41.29 
 
 
361 aa  243  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2573  calcium/proton exchanger  45.29 
 
 
331 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.144638  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4046  calcium/proton antiporter, CaCA family  38.53 
 
 
364 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633248  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1527  calcium/proton exchanger  43.88 
 
 
370 aa  227  3e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.872367  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5192  calcium/cation antiporter  40.99 
 
 
381 aa  225  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.666096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1779  calcium/proton antiporter, CaCA family  40.54 
 
 
356 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  0.740708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3000  calcium/proton antiporter, CaCA family  38.78 
 
 
366 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.555455  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07510  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  34.74 
 
 
544 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.640031  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2427  calcium/proton exchanger  41.67 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11387  predicted protein  35.1 
 
 
348 aa  209  4e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02980  calcium:hydrogen antiporter, putative  35.62 
 
 
403 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.696146  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_2762  predicted protein  29.94 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.520471  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00180  calcium ion transporter, putative  46.85 
 
 
599 aa  132  7.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0287114  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1975  sodium/calcium exchanger membrane region  43.55 
 
 
189 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00510544  normal  0.677421 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07173  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  41.89 
 
 
742 aa  123  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000380184  normal  0.53432 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05821  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  28.53 
 
 
481 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.652045 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01330  calcium ion transporter, putative  38.46 
 
 
689 aa  113  6e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.712478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1240  sodium/calcium exchanger membrane region  30.23 
 
 
365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228892 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53985  Ca2+/H+ antiporter  24.94 
 
 
967 aa  108  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0314274  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06986  calcium/ hydrogen exchanger, putative (Eurofung)  32.02 
 
 
1129 aa  97.4  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05500  conserved hypothetical protein  39.52 
 
 
1344 aa  97.4  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0764  calcium/proton antiporter, putative  25.36 
 
 
365 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0668  Sodium/calcium exchanger membrane region  25.63 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0674  Sodium/calcium exchanger membrane region  26.84 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774852  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3082  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.91 
 
 
320 aa  63.2  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3147  Ca2+/H+ antiporter  27.67 
 
 
385 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409231  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2992  sodium/calcium exchanger membrane region  27.71 
 
 
365 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198433  normal  0.141377 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1962  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.89 
 
 
323 aa  59.7  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2731  sodium/calcium exchanger membrane region  27.42 
 
 
365 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3610  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.48 
 
 
319 aa  57.4  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0339  sodium/calcium exchanger membrane region  24.29 
 
 
343 aa  57  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.3 
 
 
357 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0417  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.89 
 
 
314 aa  55.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2638  putative sodium/calcium exchanger  25.74 
 
 
305 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3860  sodium/calcium exchanger membrane region  25.82 
 
 
358 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0642  Na+/Ca+ antiporter  23.29 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1577  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.61 
 
 
311 aa  53.9  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00101794  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1979  calcium/proton antiporter  25.31 
 
 
382 aa  53.5  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0979  sodium/calcium exchanger membrane region  23.53 
 
 
365 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1188  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  21.85 
 
 
325 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3735  sodium/calcium exchanger membrane region  23.32 
 
 
371 aa  53.1  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1295  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.89 
 
 
305 aa  53.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3384  sodium/calcium exchanger membrane region  23.9 
 
 
370 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1174  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.63 
 
 
304 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0994  sodium/calcium exchanger membrane region  23.53 
 
 
361 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2262  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.54 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.436095  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0959  sodium/calcium exchanger membrane region  23.53 
 
 
361 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4234  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.09 
 
 
319 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000309074 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4537  putative sodium/calcium exchanger protein  25.88 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1078  sodium/calcium exchange protein  27.19 
 
 
323 aa  50.8  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3290  sodium/calcium exchanger membrane region  23.53 
 
 
365 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1366  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  22.64 
 
 
320 aa  50.8  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3291  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.32 
 
 
321 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0788949  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0910  sodium/calcium exchanger membrane region  23.16 
 
 
365 aa  50.4  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3387  sodium/calcium exchanger membrane region  23.53 
 
 
360 aa  50.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0305214  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07505  sodium/calcium exchanger  27.91 
 
 
316 aa  50.4  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0495  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.32 
 
 
320 aa  50.4  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000835013  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0732  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.45 
 
 
319 aa  50.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1854  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.82 
 
 
322 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0304514  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3965  sodium/calcium exchanger membrane region  23.75 
 
 
360 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116135  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.88 
 
 
325 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1889  sodium/calcium exchanger membrane region  25.46 
 
 
343 aa  47.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.106485 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2520  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.57 
 
 
357 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.522775 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>