More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0259 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 845 aa  1689    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.78 
 
 		 698 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  35.56 
 
 		 604 aa  345  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  34.12 
 
 		 699 aa  335  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  34.08 
 
 		 688 aa  322  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  38.05 
 
 		 699 aa  321  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.54 
 
 		 600 aa  320  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  37.85 
 
 		 699 aa  320  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  38.05 
 
 		 699 aa  319  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  36.41 
 
 		 520 aa  316  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.96 
 
 		 598 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33.49 
 
 		 618 aa  306  8.000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  32.79 
 
 		 734 aa  304  5.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  32.31 
 
 		 637 aa  301  5e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.96 
 
 		 543 aa  295  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  31.44 
 
 		 633 aa  295  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.95 
 
 		 543 aa  292  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.39 
 
 		 528 aa  292  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  39.95 
 
 		 444 aa  290  7e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.03 
 
 		 580 aa  289  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.8 
 
 		 596 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  30.43 
 
 		 631 aa  275  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  31.48 
 
 		 552 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.15 
 
 		 558 aa  264  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.52 
 
 		 426 aa  258  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  40.88 
 
 		 517 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  36.01 
 
 		 427 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  31.33 
 
 		 673 aa  253  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  36.81 
 
 		 656 aa  244  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.51 
 
 		 511 aa  235  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  29.59 
 
 		 511 aa  234  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  36.63 
 
 		 420 aa  233  9e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  31.98 
 
 		 1003 aa  231  6e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  38.18 
 
 		 365 aa  229  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.88 
 
 		 365 aa  228  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.88 
 
 		 365 aa  227  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  27.87 
 
 		 992 aa  222  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  27.86 
 
 		 589 aa  220  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  33.87 
 
 		 503 aa  220  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  29.03 
 
 		 971 aa  218  4e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  38.56 
 
 		 520 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  29.49 
 
 		 966 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.31 
 
 		 534 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.31 
 
 		 534 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  26.4 
 
 		 624 aa  214  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.4 
 
 		 976 aa  214  4.9999999999999996e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  30.69 
 
 		 557 aa  214  7.999999999999999e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.26 
 
 		 594 aa  212  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  27.54 
 
 		 990 aa  210  8e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  37.26 
 
 		 498 aa  209  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  38.73 
 
 		 492 aa  209  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  28.43 
 
 		 541 aa  207  8e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.41 
 
 		 484 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.53 
 
 		 1018 aa  205  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  27.78 
 
 		 585 aa  205  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.38 
 
 		 490 aa  203  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  36.58 
 
 		 542 aa  201  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0638  putative beta-glucosidase  34.25 
 
 		 531 aa  201  5e-50  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00229499  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  27.45 
 
 		 997 aa  201  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.03 
 
 		 953 aa  201  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.77 
 
 		 387 aa  201  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  37.39 
 
 		 365 aa  201  6e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  40.52 
 
 		 490 aa  200  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  26.78 
 
 		 592 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  38.06 
 
 		 370 aa  199  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  36.33 
 
 		 499 aa  198  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  36.62 
 
 		 361 aa  198  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  31.67 
 
 		 1007 aa  198  3e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.25 
 
 		 537 aa  198  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  29.23 
 
 		 528 aa  196  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.26 
 
 		 582 aa  196  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.19 
 
 		 552 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  28.82 
 
 		 1012 aa  194  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.29 
 
 		 504 aa  194  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.71 
 
 		 573 aa  193  9e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.29 
 
 		 583 aa  193  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.75 
 
 		 398 aa  192  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1416  glycosy hydrolase family protein  36.08 
 
 		 467 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2890  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.43 
 
 		 553 aa  192  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0462  putative beta-N-acetylglucosaminidase  36.08 
 
 		 467 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0430321  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.82 
 
 		 363 aa  192  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1600  beta-hexosamidase A  30.39 
 
 		 586 aa  191  7e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.592664  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4486  glycoside hydrolase family 3 protein  34.49 
 
 		 468 aa  189  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102459  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  34.39 
 
 		 543 aa  187  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  34.39 
 
 		 374 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01416  beta-N-acetylglucosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04060)  29.19 
 
 		 923 aa  186  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.249687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.6 
 
 		 568 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.28 
 
 		 482 aa  186  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  32.91 
 
 		 575 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  36.1 
 
 		 538 aa  185  3e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.79 
 
 		 373 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.71 
 
 		 530 aa  184  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.9 
 
 		 382 aa  184  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2600  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.71 
 
 		 575 aa  183  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121893 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.77 
 
 		 478 aa  182  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.84 
 
 		 591 aa  182  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1193  hypothetical protein  33.07 
 
 		 382 aa  182  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1199  hypothetical protein  31.97 
 
 		 382 aa  182  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  32.65 
 
 		 575 aa  182  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  35.25 
 
 		 538 aa  181  5.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>