More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0786 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1247  histidyl-tRNA synthetase  97.79 
 
 
408 aa  789    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0392037  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0856  histidyl-tRNA synthetase  90.93 
 
 
408 aa  736    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0786  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
408 aa  832    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00313764  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0745  histidyl-tRNA synthetase  75.74 
 
 
408 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0925  histidyl-tRNA synthetase  62.16 
 
 
410 aa  525  1e-148  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0894  histidyl-tRNA synthetase  63.3 
 
 
409 aa  526  1e-148  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0307852  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1272  histidyl-tRNA synthetase  62.35 
 
 
408 aa  520  1e-146  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694221  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1288  histidyl-tRNA synthetase  58.46 
 
 
402 aa  488  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.373559  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1130  histidyl-tRNA synthetase  57.25 
 
 
403 aa  478  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0629126  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
423 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
415 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
414 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
414 aa  329  4e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
413 aa  323  5e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
413 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
426 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
419 aa  317  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 
419 aa  316  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
415 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
416 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
421 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 
424 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 
416 aa  310  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
417 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 
414 aa  308  9e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 
424 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
424 aa  305  8.000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 
424 aa  305  9.000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
421 aa  303  4.0000000000000003e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
424 aa  302  7.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
419 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 
417 aa  301  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
422 aa  297  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
424 aa  296  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
426 aa  296  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  38.61 
 
 
422 aa  296  3e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1261  histidyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
410 aa  296  4e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.848478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 
419 aa  296  5e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
423 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
418 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 
435 aa  293  3e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
419 aa  292  6e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
417 aa  292  9e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 
429 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
426 aa  291  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 
424 aa  290  3e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 
422 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 
424 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 
419 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
426 aa  290  4e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
424 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
424 aa  289  6e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
424 aa  289  6e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
424 aa  289  6e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
424 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0009  histidyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 
416 aa  289  6e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0511453  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  38.33 
 
 
424 aa  289  6e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
424 aa  289  6e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
424 aa  289  6e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
424 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
424 aa  289  6e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
424 aa  289  6e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
424 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
424 aa  289  7e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
424 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 
424 aa  289  8e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
429 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
429 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
429 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 
424 aa  287  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 
423 aa  287  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 
421 aa  288  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 
427 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
429 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
414 aa  286  4e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 
429 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 
411 aa  285  7e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 
429 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
415 aa  285  9e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 
423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 
414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
424 aa  284  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20680  histidyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 
464 aa  284  2.0000000000000002e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 
422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1169  histidyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0566185  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 
425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 
424 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 
429 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  37.53 
 
 
423 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
425 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
421 aa  283  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
421 aa  283  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
441 aa  282  8.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 
406 aa  282  8.000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
420 aa  282  9e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 
424 aa  281  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>