More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0158 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  100 
 
 
168 aa  350  4e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  57.32 
 
 
179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  54.04 
 
 
216 aa  211  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  57.23 
 
 
199 aa  210  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  55.83 
 
 
264 aa  210  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  55.97 
 
 
182 aa  209  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7018  NADH dehydrogenase subunit B  57.05 
 
 
187 aa  208  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.42 
 
 
202 aa  208  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.35 
 
 
226 aa  208  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  55.83 
 
 
271 aa  208  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.82 
 
 
170 aa  207  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  56.77 
 
 
791 aa  207  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.17 
 
 
170 aa  207  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  54.04 
 
 
174 aa  206  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  53.46 
 
 
182 aa  205  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3857  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.27 
 
 
230 aa  205  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2157  NADH dehydrogenase subunit B  57.62 
 
 
193 aa  204  4e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00451511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  57.82 
 
 
171 aa  204  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  55.06 
 
 
792 aa  204  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  56.58 
 
 
183 aa  204  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  56.58 
 
 
183 aa  204  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0585  NADH dehydrogenase subunit B  56.77 
 
 
222 aa  202  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  55.48 
 
 
226 aa  202  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0574  NADH dehydrogenase subunit B  56.77 
 
 
222 aa  202  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.21 
 
 
170 aa  202  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1698  NADH dehydrogenase subunit B  56.77 
 
 
222 aa  202  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0268752  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  57.93 
 
 
793 aa  202  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  53.16 
 
 
179 aa  202  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1381  NADH dehydrogenase subunit B  56.49 
 
 
181 aa  202  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.186905  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  53.5 
 
 
794 aa  201  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.53 
 
 
179 aa  201  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  55.48 
 
 
226 aa  201  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  53.5 
 
 
794 aa  201  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  54.84 
 
 
184 aa  201  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1245  NADH dehydrogenase subunit B  50.61 
 
 
182 aa  200  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  54.84 
 
 
178 aa  200  7e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.5 
 
 
183 aa  200  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 
220 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1370  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.63 
 
 
220 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00721379  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  55.63 
 
 
220 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 
220 aa  199  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 
220 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 
220 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  60.96 
 
 
213 aa  199  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 
220 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2580  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 
220 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3426  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 
220 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101338  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  54.19 
 
 
184 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2673  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 
220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104558  normal  0.525556 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2511  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 
220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0438233  normal  0.552577 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2466  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 
220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000315164  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2566  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 
220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112494  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2555  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 
220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.66 
 
 
183 aa  198  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5099  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.85 
 
 
181 aa  198  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.97 
 
 
180 aa  198  3e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  51.66 
 
 
213 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.97 
 
 
184 aa  197  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.49 
 
 
169 aa  197  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  55 
 
 
183 aa  197  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.33 
 
 
163 aa  197  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1624  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.33 
 
 
163 aa  197  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.598307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3192  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.33 
 
 
163 aa  197  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.95 
 
 
184 aa  197  7.999999999999999e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  55.35 
 
 
170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  52.9 
 
 
185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  54.3 
 
 
167 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  53.59 
 
 
167 aa  195  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1014  NADH dehydrogenase subunit B  54.61 
 
 
221 aa  195  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2831  NADH dehydrogenase subunit B  54.19 
 
 
224 aa  195  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00179676  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.61 
 
 
181 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.84 
 
 
183 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1181  NADH dehydrogenase subunit B  54.37 
 
 
235 aa  194  5.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468276  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4081  NADH dehydrogenase subunit B  54.55 
 
 
180 aa  194  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.343571  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1126  NADH dehydrogenase subunit B  50.99 
 
 
212 aa  194  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  56 
 
 
173 aa  193  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1561  NADH dehydrogenase subunit B  53.55 
 
 
225 aa  192  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1815  NADH dehydrogenase subunit B  53.55 
 
 
225 aa  192  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  54.09 
 
 
170 aa  193  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1020  NADH dehydrogenase subunit B  56.46 
 
 
224 aa  192  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1872  NADH dehydrogenase subunit B  52.26 
 
 
225 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.681353  normal  0.231818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3198  NADH dehydrogenase subunit B  52.26 
 
 
224 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722049  normal  0.022092 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2413  NADH dehydrogenase subunit B  52.26 
 
 
225 aa  192  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119197  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  53.95 
 
 
264 aa  192  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  54.48 
 
 
787 aa  192  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4120  NADH dehydrogenase subunit B  52.26 
 
 
225 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3692  NADH dehydrogenase subunit B  52.26 
 
 
225 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.779049  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1745  NADH dehydrogenase subunit B  52.26 
 
 
225 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440453  normal  0.328312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3366  NADH dehydrogenase I, B subunit  52.26 
 
 
224 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2569  NADH dehydrogenase subunit B  52.26 
 
 
225 aa  191  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3604  NADH dehydrogenase subunit B  52.26 
 
 
224 aa  192  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  52.26 
 
 
184 aa  191  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30010  NADH dehydrogenase subunit B  52.26 
 
 
225 aa  191  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3307  NADH dehydrogenase subunit B  57.25 
 
 
224 aa  191  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000318013  normal  0.583268 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1291  NADH dehydrogenase subunit B  59.85 
 
 
183 aa  191  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.378148  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  51.97 
 
 
184 aa  191  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  51.97 
 
 
184 aa  191  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  51.32 
 
 
794 aa  191  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0380  NADH dehydrogenase subunit B  53.55 
 
 
224 aa  191  6e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.8672  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28450  NADH dehydrogenase subunit B  52.6 
 
 
224 aa  191  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>