More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1745 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1745  putative ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
230 aa  455  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00365459  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1574  ABC transporter related protein  48.5 
 
 
236 aa  215  5e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0399  ABC transporter related protein  43.93 
 
 
249 aa  204  6e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1574  ABC transporter related  42.5 
 
 
247 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.212668  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  39 
 
 
256 aa  175  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  42.74 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  42.21 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2628  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.68 
 
 
270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.197945  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 
284 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  40.16 
 
 
254 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  40 
 
 
259 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  40.44 
 
 
269 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  37.04 
 
 
272 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  42.28 
 
 
253 aa  169  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  39.75 
 
 
254 aa  168  5e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0032  ABC transporter related  41.78 
 
 
265 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  39.51 
 
 
260 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  36.82 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  39.11 
 
 
265 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4848  Sigma 54 interacting domain protein  37.86 
 
 
253 aa  166  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.627338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  37.86 
 
 
253 aa  165  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  38.43 
 
 
246 aa  165  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  39.83 
 
 
262 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  40.82 
 
 
255 aa  166  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  38.52 
 
 
254 aa  166  4e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  42.8 
 
 
259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  39.92 
 
 
259 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  38.84 
 
 
281 aa  164  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  41 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  38.17 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  41.96 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  38.59 
 
 
281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  40.82 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  40.57 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  37.5 
 
 
264 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4216  ABC transporter related  38.59 
 
 
256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  40.59 
 
 
272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  39.33 
 
 
252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4264  ABC transporter related  36.78 
 
 
255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  37.76 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  40.59 
 
 
272 aa  162  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  41.32 
 
 
265 aa  161  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  40.59 
 
 
272 aa  161  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  40.41 
 
 
274 aa  161  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  41.25 
 
 
289 aa  161  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  38.93 
 
 
254 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  38.66 
 
 
251 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  40.83 
 
 
287 aa  160  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  34.71 
 
 
436 aa  160  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  41.18 
 
 
267 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  37.04 
 
 
269 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  38.43 
 
 
281 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  40 
 
 
274 aa  160  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  39.24 
 
 
252 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  38.6 
 
 
258 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  40.76 
 
 
263 aa  159  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  38.91 
 
 
271 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  38.02 
 
 
281 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  38.11 
 
 
287 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  40.66 
 
 
279 aa  159  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  38.02 
 
 
281 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  40 
 
 
262 aa  159  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  34.3 
 
 
436 aa  159  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  41.74 
 
 
256 aa  159  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  39.82 
 
 
266 aa  158  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  41.09 
 
 
245 aa  159  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  39.26 
 
 
256 aa  159  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  38.91 
 
 
271 aa  158  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  38.94 
 
 
269 aa  158  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 
279 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  37.13 
 
 
247 aa  158  8e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 
279 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  38.08 
 
 
272 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  38.87 
 
 
258 aa  157  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  37.82 
 
 
251 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  40 
 
 
265 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  41.15 
 
 
258 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  39.33 
 
 
253 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  38.49 
 
 
271 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1665  ABC transporter  40.27 
 
 
561 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0690908  normal  0.0741534 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  39.23 
 
 
267 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2338  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  35.93 
 
 
276 aa  156  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685879  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2786  ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 
232 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0961461  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  41.45 
 
 
254 aa  156  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  37.86 
 
 
298 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  38.27 
 
 
273 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19370  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  36.4 
 
 
326 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  37.3 
 
 
260 aa  157  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  37.7 
 
 
287 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  38.08 
 
 
271 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  37.04 
 
 
269 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4472  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  38.5 
 
 
265 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.75399 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  37.76 
 
 
252 aa  156  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  36.78 
 
 
258 aa  156  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  40.32 
 
 
297 aa  155  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  37.86 
 
 
288 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  39.58 
 
 
293 aa  155  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  36.84 
 
 
257 aa  155  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  39.58 
 
 
293 aa  155  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  39.73 
 
 
257 aa  155  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>