More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03370 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 511 aa  1060    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  63.01 
 
 		 501 aa  659    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  59.49 
 
 		 500 aa  627  1e-178  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1566  glutamyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 505 aa  548  1e-155  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  50.29 
 
 		 509 aa  522  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 		 517 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 510 aa  512  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 512 aa  513  1e-144  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 516 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 500 aa  488  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4251  glutamyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 502 aa  485  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 502 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 502 aa  403  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 502 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 502 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 504 aa  397  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 503 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 484 aa  346  6e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 487 aa  344  2e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 486 aa  341  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 490 aa  341  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 492 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 484 aa  340  4e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 494 aa  340  5e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 		 501 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 503 aa  332  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  37.48 
 
 		 476 aa  331  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 488 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 491 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 505 aa  326  7e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 492 aa  326  8.000000000000001e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 		 495 aa  325  8.000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 490 aa  325  1e-87  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 		 493 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 		 479 aa  323  4e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  36.63 
 
 		 495 aa  322  9.000000000000001e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 493 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 482 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 		 493 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 493 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 485 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 493 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 507 aa  319  7e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 509 aa  319  9e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 		 466 aa  318  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 493 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 514 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 		 465 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 		 488 aa  317  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  36.35 
 
 		 490 aa  317  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 479 aa  317  4e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 493 aa  315  9e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  35.94 
 
 		 493 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 		 509 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 466 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 504 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 		 480 aa  313  4.999999999999999e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  36.65 
 
 		 506 aa  313  5.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 490 aa  313  5.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 493 aa  312  9e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 503 aa  311  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 		 491 aa  311  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 		 480 aa  311  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  37.07 
 
 		 546 aa  311  2e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 		 493 aa  310  5e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 489 aa  310  5e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 		 493 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 506 aa  309  9e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 		 471 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 		 504 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 495 aa  307  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  34.45 
 
 		 480 aa  307  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 		 467 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 471 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 471 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 471 aa  306  6e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 		 494 aa  306  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 		 494 aa  306  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 484 aa  306  7e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 484 aa  306  7e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 496 aa  306  7e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 		 485 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 		 471 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 		 485 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57984  glutamyl-tRNA synthetase, mitochondrial  37.94 
 
 		 491 aa  303  4.0000000000000003e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.604011  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 494 aa  303  7.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 		 470 aa  302  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 		 469 aa  301  1e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 		 489 aa  302  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 		 473 aa  301  1e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  34.06 
 
 		 468 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 		 469 aa  300  3e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  34.06 
 
 		 471 aa  299  7e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 		 467 aa  299  8e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 		 484 aa  299  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 		 467 aa  299  8e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 		 468 aa  299  8e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 		 469 aa  298  1e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 		 485 aa  298  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>