More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1391 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  85.53 
 
 
387 aa  666    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  86.82 
 
 
387 aa  654    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  90.18 
 
 
387 aa  698    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  100 
 
 
387 aa  775    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  40.62 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0758  alpha/beta hydrolase fold  35.8 
 
 
253 aa  113  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.294799  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
309 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  32.54 
 
 
425 aa  98.6  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 
265 aa  97.4  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  32.11 
 
 
279 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 
284 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
271 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22440  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.43 
 
 
254 aa  95.9  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  32.02 
 
 
268 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  32.81 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 
254 aa  93.6  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.7 
 
 
320 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 
350 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
273 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
352 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
268 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.13 
 
 
262 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
280 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  32.57 
 
 
261 aa  89.7  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  29.67 
 
 
510 aa  89.7  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 
290 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 
260 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
275 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.19 
 
 
265 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
279 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 
270 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.92 
 
 
248 aa  87.8  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 
265 aa  87  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
271 aa  86.7  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  41.07 
 
 
285 aa  86.3  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  32.56 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.1 
 
 
380 aa  85.9  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 
263 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.27 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  31.69 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 
307 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  25.47 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  32.44 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 
257 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3133  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  24.69 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
270 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  31.47 
 
 
266 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 
270 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  29.11 
 
 
263 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  30.4 
 
 
262 aa  82.8  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0665  thioesterase  32.78 
 
 
475 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 
266 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  29.39 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  29.39 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  27.52 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  28.09 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  28.09 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  29.39 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  31.06 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  28.2 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  30.4 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  27.76 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1659  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00584472  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  31.7 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  28.63 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  37.97 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  28.79 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  28.27 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2305  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>