More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3370 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  495  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4080  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  58.9 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.515439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 243 aa  178  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 243 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 308 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  42.49 
 
 		 277 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  42.06 
 
 		 240 aa  175  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  42.49 
 
 		 240 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  42.49 
 
 		 240 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  39.13 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  38.63 
 
 		 247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4833  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 246 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0722  GntR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0732  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 241 aa  128  8.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.128467  decreased coverage  0.000000465533 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  33.02 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 269 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  34.05 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1823  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 274 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 274 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 271 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 274 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 274 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  32.9 
 
 		 243 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  34.06 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 266 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 249 aa  111  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1764  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.140741  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.92 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 284 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.56 
 
 		 256 aa  108  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 287 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 332 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 376 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 376 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  28.24 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  29.52 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 241 aa  99.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 		 245 aa  99.4  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  35.41 
 
 		 269 aa  99.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 246 aa  99  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 239 aa  99  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 255 aa  98.6  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3533  GntR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 246 aa  96.3  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  24.89 
 
 		 235 aa  95.1  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  26.29 
 
 		 240 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6218  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0894  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.76 
 
 		 280 aa  93.2  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1940  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 244 aa  93.2  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331294  normal  0.596392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>