72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2152 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  59.04 
 
 		 606 aa  704    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  58.87 
 
 		 606 aa  702    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  70 
 
 		 599 aa  818    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 		 615 aa  1228    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  58.52 
 
 		 618 aa  680    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  61.16 
 
 		 506 aa  630  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  50.52 
 
 		 585 aa  519  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  27.15 
 
 		 541 aa  133  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.45 
 
 		 612 aa  100  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.16 
 
 		 619 aa  100  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0033  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.9 
 
 		 613 aa  93.2  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  22.53 
 
 		 627 aa  92.8  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.38 
 
 		 683 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.39 
 
 		 609 aa  89.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.38 
 
 		 683 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.38 
 
 		 683 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.38 
 
 		 684 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.13 
 
 		 663 aa  88.6  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.25 
 
 		 658 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.02 
 
 		 659 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.44 
 
 		 665 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  21.35 
 
 		 610 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.51 
 
 		 631 aa  82.8  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  21.02 
 
 		 484 aa  79.3  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.12 
 
 		 627 aa  77  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  23.49 
 
 		 634 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  25.05 
 
 		 592 aa  74.7  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  21.36 
 
 		 615 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.11 
 
 		 634 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.12 
 
 		 361 aa  70.1  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  34.97 
 
 		 490 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.2 
 
 		 581 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  20.54 
 
 		 577 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  37.5 
 
 		 840 aa  68.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  46.58 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.43 
 
 		 581 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.07 
 
 		 581 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.3 
 
 		 497 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.71 
 
 		 852 aa  62  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  27.48 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.14 
 
 		 398 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  24.47 
 
 		 885 aa  59.3  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.41 
 
 		 580 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1725  peptidase M14 carboxypeptidase A  43.01 
 
 		 355 aa  57  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  31.73 
 
 		 490 aa  57  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1583  hypothetical protein  44.07 
 
 		 452 aa  55.5  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0370379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2367  peptidase M14, carboxypeptidase A  28 
 
 		 580 aa  54.7  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  normal  0.513126 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.49 
 
 		 526 aa  54.3  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  32.38 
 
 		 392 aa  54.3  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.2 
 
 		 874 aa  53.5  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.15 
 
 		 384 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  29.96 
 
 		 1057 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1734  murein peptide amidase A  27.13 
 
 		 249 aa  51.6  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461062  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.95 
 
 		 262 aa  50.8  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07966  hypothetical protein  25 
 
 		 570 aa  50.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.684592  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0312  hypothetical protein  37.62 
 
 		 293 aa  50.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  24.32 
 
 		 575 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28380  Zinc carboxypeptidase  31.03 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10433  hypothetical protein  24.43 
 
 		 388 aa  49.7  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.968158  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5008  deacylase-like protein  37.62 
 
 		 293 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  25.71 
 
 		 906 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  34.41 
 
 		 429 aa  48.5  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  26.62 
 
 		 836 aa  48.1  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.31 
 
 		 432 aa  47.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.56 
 
 		 393 aa  47.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.39 
 
 		 848 aa  45.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  31.17 
 
 		 365 aa  45.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.46 
 
 		 428 aa  44.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3277  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33 
 
 		 406 aa  44.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1132  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.33 
 
 		 400 aa  44.3  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2299  murein peptide amidase A  29.23 
 
 		 242 aa  43.9  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.79 
 
 		 378 aa  43.9  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>