More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4930 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 		 258 aa  536  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  96.51 
 
 		 258 aa  517  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  70.75 
 
 		 255 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  71.95 
 
 		 255 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  67.06 
 
 		 256 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  72.22 
 
 		 255 aa  345  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  65.13 
 
 		 263 aa  343  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  71.76 
 
 		 255 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  72.09 
 
 		 215 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  65.13 
 
 		 263 aa  342  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  59.67 
 
 		 259 aa  331  5e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  59.85 
 
 		 263 aa  328  6e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  59.92 
 
 		 258 aa  327  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  58.3 
 
 		 262 aa  323  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  64.05 
 
 		 263 aa  323  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  59.77 
 
 		 262 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  59.77 
 
 		 262 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  61.92 
 
 		 262 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  61.51 
 
 		 262 aa  316  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  60.74 
 
 		 263 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  60.74 
 
 		 263 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  60.74 
 
 		 263 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  62.81 
 
 		 258 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  60.74 
 
 		 263 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  60.74 
 
 		 263 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  60.33 
 
 		 263 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  60.33 
 
 		 263 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.09 
 
 		 262 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.7 
 
 		 262 aa  310  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  57.98 
 
 		 263 aa  309  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  62.75 
 
 		 262 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  59.32 
 
 		 249 aa  307  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  59.67 
 
 		 257 aa  306  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  58.68 
 
 		 263 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  63.76 
 
 		 263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  59.5 
 
 		 257 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  59.38 
 
 		 263 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  59.76 
 
 		 263 aa  302  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  60 
 
 		 263 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  57.63 
 
 		 249 aa  294  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  56.56 
 
 		 259 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  58.95 
 
 		 259 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  59.39 
 
 		 259 aa  291  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.76 
 
 		 261 aa  291  7e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  53.54 
 
 		 260 aa  291  9e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  54.92 
 
 		 259 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  58.3 
 
 		 239 aa  275  4e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  51.9 
 
 		 241 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  55.27 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  51.03 
 
 		 263 aa  261  8e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  40.16 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.27 
 
 		 249 aa  159  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  35.97 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.2 
 
 		 251 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  36.36 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  37.35 
 
 		 262 aa  155  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  35.29 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  36.84 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.13 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  37.93 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  35.27 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  35.27 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  37.34 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  36.48 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.34 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  37.34 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.58 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  35.25 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  31.73 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  31.73 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  30.92 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.27 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  35.9 
 
 		 495 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.68 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  37.5 
 
 		 315 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.38 
 
 		 237 aa  97.8  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  37.5 
 
 		 315 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.1 
 
 		 517 aa  95.9  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.08 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.98 
 
 		 501 aa  92.4  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.51 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  37.65 
 
 		 319 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.82 
 
 		 332 aa  89.4  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.348188 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2981  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.83 
 
 		 331 aa  89  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.11 
 
 		 313 aa  88.6  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  35.76 
 
 		 318 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0693  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.31 
 
 		 332 aa  87.8  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.82 
 
 		 331 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0368  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.14 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2817  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.61 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0157  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.63 
 
 		 321 aa  86.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.337145 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.03 
 
 		 465 aa  86.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1410  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.18 
 
 		 301 aa  85.9  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.77 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.24 
 
 		 318 aa  85.9  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0077  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.18 
 
 		 301 aa  85.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.85 
 
 		 199 aa  85.1  9e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3259  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.39 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439006  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3141  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.37 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258907  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0384  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.46 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10592  normal  0.557943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>