213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1268 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0719  fimbrial usher protein  63.55 
 
 		 766 aa  936    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.308044  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1220  fimbrial usher protein  63.96 
 
 		 803 aa  943    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348737  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4395  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  67.21 
 
 		 794 aa  1042    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5759  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  62.35 
 
 		 785 aa  919    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0865  fimbrial usher protein  63.05 
 
 		 842 aa  952    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142606  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2475  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  62.13 
 
 		 748 aa  940    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2294  fimbrial usher protein  63.55 
 
 		 766 aa  936    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2992  fimbrial usher protein  63.69 
 
 		 984 aa  938    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1062  P pilus assembly protein, porin PapC  63.96 
 
 		 766 aa  942    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1069  fimbrial usher protein  63.71 
 
 		 766 aa  945    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1607  fimbrial usher protein  63.69 
 
 		 766 aa  937    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1268  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  100 
 
 		 849 aa  1711    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0271633  normal  0.105864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2341  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  62.14 
 
 		 816 aa  926    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194794 
 
 
-
 
NC_003296  RS03043  signal peptide protein  45.28 
 
 		 786 aa  628  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.117793  normal  0.374685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1921  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.13 
 
 		 775 aa  432  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2677  fimbrial usher protein  36.88 
 
 		 766 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.48 
 
 		 808 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.218123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1793  putative fimbriae-related protein  35.95 
 
 		 810 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1636  fimbrial usher protein  35.95 
 
 		 803 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1399  fimbrial usher protein  35.95 
 
 		 782 aa  395  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0477  fimbrial usher family protein  35.95 
 
 		 803 aa  395  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.468363  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.42 
 
 		 834 aa  390  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01136  outer membrane usher protein FasD  36.29 
 
 		 783 aa  392  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0354539  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1614  fimbrial usher protein  36.03 
 
 		 803 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3333  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.71 
 
 		 797 aa  386  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2362  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.32 
 
 		 797 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1802  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.31 
 
 		 781 aa  383  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0548904  normal  0.220264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1962  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.19 
 
 		 765 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0008  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.99 
 
 		 807 aa  368  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.333359  hitchhiker  0.00375796 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0007  outer membrane usher protein, putative  32.9 
 
 		 814 aa  368  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61540  hypothetical protein  34.21 
 
 		 790 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.675454  normal  0.215257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5301  hypothetical protein  33.86 
 
 		 790 aa  366  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2459  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.29 
 
 		 794 aa  359  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2108  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.74 
 
 		 782 aa  358  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424267 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1446  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.17 
 
 		 789 aa  347  4e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2819  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.62 
 
 		 788 aa  347  5e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.88 
 
 		 786 aa  339  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.930496 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2671  fimbrial usher protein  32.08 
 
 		 815 aa  335  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0183033 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1774  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.08 
 
 		 815 aa  334  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.613765  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1663  fimbrial usher protein  31.95 
 
 		 815 aa  333  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1270  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.18 
 
 		 790 aa  325  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.465422 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2693  putative outer membrane usher transmembrane protein  28.76 
 
 		 754 aa  278  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.513198 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0610  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.59 
 
 		 798 aa  242  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000874993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001218  CsuD  28.61 
 
 		 804 aa  235  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0144  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.43 
 
 		 791 aa  233  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0304  fimbrial biogenesis protein  30.02 
 
 		 788 aa  231  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0342  putative outer membrane usher protein fimD  27.53 
 
 		 765 aa  231  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0778  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.76 
 
 		 778 aa  223  8e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.243314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2057  fimbrial biogenesis protein  25.52 
 
 		 834 aa  170  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000165922  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3740  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.68 
 
 		 778 aa  137  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540058  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0535  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.32 
 
 		 734 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.02 
 
 		 778 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3599  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.06 
 
 		 778 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.84 
 
 		 866 aa  88.6  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1499  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.28 
 
 		 832 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3782  fimbrial usher protein  22.64 
 
 		 792 aa  70.1  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  30.64 
 
 		 836 aa  69.3  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.200021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0331  outer-membrane fimbrial usher protein  30.64 
 
 		 836 aa  69.3  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0670  fimbrial usher protein  22.64 
 
 		 792 aa  69.3  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0189299  normal  0.787892 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  27.75 
 
 		 913 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  27.75 
 
 		 914 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  27.75 
 
 		 914 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0330  outer-membrane fimbrial usher protein  30.64 
 
 		 836 aa  68.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.428849  normal  0.361792 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3870  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.51 
 
 		 792 aa  68.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.56 
 
 		 880 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0763  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.13 
 
 		 852 aa  67  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.794501  normal  0.0266103 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  30.06 
 
 		 836 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0185038 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0832  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.89 
 
 		 853 aa  66.6  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.646384  normal  0.17108 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.42 
 
 		 876 aa  67  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  27.37 
 
 		 939 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1889  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.34 
 
 		 831 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716127 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  32.17 
 
 		 833 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.83 
 
 		 837 aa  63.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  33.06 
 
 		 850 aa  62  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  33.06 
 
 		 833 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  33.06 
 
 		 833 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.2 
 
 		 886 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  23 
 
 		 809 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  23 
 
 		 809 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.81 
 
 		 851 aa  60.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0934  fimbrial usher protein  22.38 
 
 		 826 aa  60.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  23 
 
 		 809 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2496  fimbrial usher protein  30.12 
 
 		 882 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  23 
 
 		 809 aa  60.1  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  27.66 
 
 		 838 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  27.66 
 
 		 838 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  27.66 
 
 		 838 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.66 
 
 		 838 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  27.66 
 
 		 838 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.47 
 
 		 856 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  22.83 
 
 		 809 aa  59.3  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0168  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.8 
 
 		 864 aa  58.5  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.26 
 
 		 930 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1538  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.53 
 
 		 826 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.95 
 
 		 838 aa  58.2  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0209  putative outer membrane usher protein  27.89 
 
 		 865 aa  58.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2399  fimbrial usher protein  21.86 
 
 		 826 aa  58.2  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1548  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.53 
 
 		 826 aa  58.2  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.2778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  26.95 
 
 		 863 aa  58.2  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2245  fimbrial usher protein  21.53 
 
 		 826 aa  57.8  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.141315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>