94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7014 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  100 
 
 
361 aa  725    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6121  ImpA domain-containing protein  78.61 
 
 
361 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537436  normal  0.338806 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  63.11 
 
 
365 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0948  ImpA domain protein  65.13 
 
 
368 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  58.09 
 
 
367 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1902  hypothetical protein  60.06 
 
 
367 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0913  hypothetical protein  60.06 
 
 
367 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1200  hypothetical protein  60.06 
 
 
367 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3901  ImpA domain-containing protein  53.42 
 
 
372 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.968784 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2175  ImpA-related N-terminal family protein  61.76 
 
 
345 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0341  ImpA, N-terminal  60.11 
 
 
367 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.402046  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0250  ImpA-related N-terminal family protein  59.39 
 
 
371 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0973  ImpA-like protein  54.82 
 
 
372 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1702  ImpA-like N-terminal family protein  60.06 
 
 
367 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  40.11 
 
 
356 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  43.06 
 
 
354 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1692  type VI secretion-associated protein, ImpA family  42.22 
 
 
360 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  39.38 
 
 
356 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  39.38 
 
 
356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0296  ImpA-related N- family protein  42.86 
 
 
347 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.644226 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  39.38 
 
 
356 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0289  ImpA-related protein  43.93 
 
 
351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0304  ImpA-related N- family protein  43.64 
 
 
349 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0291  ImpA-related N- family protein  43.35 
 
 
349 aa  239  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15903  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  42.21 
 
 
352 aa  228  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2699  ImpA domain-containing protein  28.84 
 
 
393 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.325925  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1359  ImpA domain-containing protein  28.95 
 
 
397 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.906132  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1471  ImpA domain-containing protein  28.95 
 
 
397 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  32.49 
 
 
345 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  28.69 
 
 
346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.3 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.98 
 
 
345 aa  106  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  25.74 
 
 
339 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  31.1 
 
 
344 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  26.3 
 
 
341 aa  102  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.23 
 
 
363 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  29.72 
 
 
340 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  29.62 
 
 
343 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  33.71 
 
 
354 aa  86.7  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2961  ImpA-related N-terminal family protein  33.71 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  38.58 
 
 
344 aa  82.4  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  33.15 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2836  ImpA-related N-terminal family protein  33.15 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000685446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0452  ImpA-related N-terminal family protein  33.15 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  33.15 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  33.15 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1599  hypothetical protein  33.15 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.595885  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  27.46 
 
 
357 aa  79  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  31.82 
 
 
342 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  26.16 
 
 
362 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  25 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  26.84 
 
 
373 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  26.84 
 
 
373 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  26.15 
 
 
373 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1589  ImpA-like  28.85 
 
 
371 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449163  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2442  ImpA domain-containing protein  33.56 
 
 
376 aa  60.1  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.34 
 
 
369 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  26.84 
 
 
373 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  26.65 
 
 
369 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5997  ImpA family type VI secretion-associated protein  24.79 
 
 
382 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  24.79 
 
 
366 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1045  hypothetical protein  22.73 
 
 
312 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855246  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2019  ImpA-related N-terminal family protein  22.73 
 
 
312 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0750  hypothetical protein  22.73 
 
 
312 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1761  hypothetical protein  22.73 
 
 
312 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  25.07 
 
 
373 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  26.88 
 
 
373 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  26.88 
 
 
373 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  27.17 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  27.17 
 
 
373 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  25.66 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  27.17 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  27.17 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  27.17 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  25.66 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1528  hypothetical protein  25.75 
 
 
371 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0699  ImpA-related N-terminal family protein  22.42 
 
 
312 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0788  ImpA-related N-terminal family protein  22.42 
 
 
312 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2073  hypothetical protein  22.42 
 
 
300 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  28.27 
 
 
363 aa  52.8  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0764  ImpA domain-containing protein  19.73 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00810517  normal  0.0303687 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  33.33 
 
 
524 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3566  ImpA domain-containing protein  19.73 
 
 
328 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  25.42 
 
 
337 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3437  ImpA domain-containing protein  19.73 
 
 
337 aa  50.4  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00156719  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  28.57 
 
 
522 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1902  ImpA-like N-terminal family protein  23.85 
 
 
314 aa  47.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  27.88 
 
 
533 aa  46.6  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  29.06 
 
 
534 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  28.21 
 
 
530 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  26.98 
 
 
439 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  27.7 
 
 
439 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  22.64 
 
 
366 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  30.08 
 
 
527 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>