294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4689 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  100 
 
 		 467 aa  940    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  89.89 
 
 		 467 aa  817    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  89.46 
 
 		 467 aa  817    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  82.23 
 
 		 475 aa  747    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  87.15 
 
 		 467 aa  779    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  59.4 
 
 		 553 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  59.6 
 
 		 553 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  58.52 
 
 		 554 aa  542  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  58.92 
 
 		 552 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  59.59 
 
 		 549 aa  534  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  58.23 
 
 		 575 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  58.23 
 
 		 575 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  58 
 
 		 553 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  57.8 
 
 		 553 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  57.8 
 
 		 553 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  55.24 
 
 		 550 aa  522  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  56.04 
 
 		 551 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  54.4 
 
 		 545 aa  506  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  57.44 
 
 		 537 aa  504  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  56.29 
 
 		 552 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  54.66 
 
 		 549 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  56.4 
 
 		 545 aa  498  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  54.6 
 
 		 549 aa  494  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  55.89 
 
 		 552 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  54.02 
 
 		 548 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  53.86 
 
 		 547 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  56.2 
 
 		 545 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  55.99 
 
 		 545 aa  488  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  53.92 
 
 		 558 aa  486  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  52.81 
 
 		 546 aa  482  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  54 
 
 		 553 aa  484  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  54.36 
 
 		 538 aa  483  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  55.35 
 
 		 552 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  55.79 
 
 		 566 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  52.05 
 
 		 556 aa  476  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  52.82 
 
 		 556 aa  462  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1386  major facilitator transporter  47.42 
 
 		 570 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.863121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  54.02 
 
 		 456 aa  433  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  54.49 
 
 		 471 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  52.31 
 
 		 463 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  52.41 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  53.07 
 
 		 455 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  52.75 
 
 		 464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  51.85 
 
 		 518 aa  395  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  52.78 
 
 		 448 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  49.89 
 
 		 507 aa  379  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  43.08 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 412 aa  310  2.9999999999999997e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  36.53 
 
 		 418 aa  295  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  42.34 
 
 		 421 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  41.91 
 
 		 413 aa  284  3.0000000000000004e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  40.47 
 
 		 424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  38.96 
 
 		 424 aa  256  8e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  40.62 
 
 		 406 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  36.69 
 
 		 397 aa  249  7e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  36.43 
 
 		 401 aa  247  3e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  36.78 
 
 		 424 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  35.89 
 
 		 442 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  32.14 
 
 		 428 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 453 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  36.21 
 
 		 938 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 		 425 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 419 aa  159  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  29 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 421 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 432 aa  150  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 		 421 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 415 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 411 aa  139  8.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2629  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  27.85 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  26.57 
 
 		 412 aa  137  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  26.97 
 
 		 410 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32095  predicted protein  39.64 
 
 		 679 aa  132  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  28.79 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  27.36 
 
 		 412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  27.32 
 
 		 402 aa  127  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  26.12 
 
 		 402 aa  126  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  26.12 
 
 		 402 aa  126  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  26.39 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2465  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 454 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  26.24 
 
 		 398 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  29.26 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  26.24 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  26 
 
 		 398 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  26 
 
 		 398 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  26 
 
 		 398 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>