More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0183 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0402  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  83.07 
 
 
528 aa  898  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882442  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0349  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  84.25 
 
 
528 aa  890  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.827651  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5193  extracellular solute-binding protein  61.33 
 
 
529 aa  673  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0587295  normal  0.27415 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  84.65 
 
 
531 aa  905  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6093  putative dipeptide ABC transporter binding protein subunit  61.45 
 
 
526 aa  682  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.500432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0584  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  82.87 
 
 
528 aa  897  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.542939  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  89.1 
 
 
528 aa  982  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  83.66 
 
 
531 aa  894  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0223  extracellular solute-binding protein  63.06 
 
 
528 aa  654  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2283  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  83.07 
 
 
528 aa  899  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0422  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  83.27 
 
 
528 aa  899  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537378  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70200  putative binding protein component of ABC dipeptide transporter  62.77 
 
 
526 aa  680  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  84.25 
 
 
534 aa  901  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  59.6 
 
 
525 aa  663  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  85.24 
 
 
531 aa  911  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  84.25 
 
 
534 aa  901  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3091  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  83.07 
 
 
528 aa  899  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2005  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  83.07 
 
 
528 aa  899  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  88.91 
 
 
528 aa  979  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0091  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  83.07 
 
 
528 aa  899  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5283  periplasmic dipeptide-binding protein, putative  62.45 
 
 
529 aa  649  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  84.82 
 
 
531 aa  918  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5334  extracellular solute-binding protein  61.86 
 
 
535 aa  643  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805263 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
532 aa  1093  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  84.06 
 
 
531 aa  899  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0087  bacterial extracellular solute-binding protein, family 5  61.86 
 
 
528 aa  655  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0187  extracellular solute-binding protein  61.22 
 
 
529 aa  676  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  1.20375e-06 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5538  extracellular solute-binding protein  63.06 
 
 
528 aa  676  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332617  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4375  4-phytase  56.54 
 
 
525 aa  632  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  51.67 
 
 
533 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  51.57 
 
 
531 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4238  extracellular solute-binding protein  50.78 
 
 
531 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301487  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12520  dipeptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding component  48.81 
 
 
537 aa  548  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0296833  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4561  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  50.39 
 
 
531 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  49.01 
 
 
531 aa  544  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0882  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  49.61 
 
 
544 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0813  extracellular solute-binding protein  49.8 
 
 
531 aa  540  1e-152  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125368  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0921  extracellular solute-binding protein  49.22 
 
 
536 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.776476  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4296  extracellular solute-binding protein  48.2 
 
 
531 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257984  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0925  extracellular solute-binding protein  48.63 
 
 
536 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  47.09 
 
 
547 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0182  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  47.81 
 
 
542 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3754  extracellular solute-binding protein family 5  48 
 
 
542 aa  504  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.884226 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  46.02 
 
 
526 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  46.02 
 
 
526 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  46.02 
 
 
526 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0181  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  47.55 
 
 
547 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  46.02 
 
 
526 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0816  extracellular solute-binding protein  48.22 
 
 
533 aa  498  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  46.21 
 
 
526 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3040  extracellular solute-binding protein  49.24 
 
 
542 aa  500  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.607327 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  46.02 
 
 
535 aa  499  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  45.83 
 
 
535 aa  498  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  45.83 
 
 
535 aa  498  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  47.79 
 
 
537 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  47.95 
 
 
543 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  45.83 
 
 
535 aa  498  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  45.76 
 
 
535 aa  497  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  45.36 
 
 
532 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  45.64 
 
 
535 aa  497  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  45.85 
 
 
535 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  45.85 
 
 
535 aa  496  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  45.83 
 
 
535 aa  498  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  45.83 
 
 
535 aa  498  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  45.85 
 
 
535 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  48.65 
 
 
532 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  45.28 
 
 
532 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  45.95 
 
 
531 aa  498  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  46.4 
 
 
535 aa  497  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  45.83 
 
 
535 aa  498  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  45.01 
 
 
535 aa  496  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2969  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  49.12 
 
 
542 aa  491  1e-138  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0256  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  49.31 
 
 
542 aa  491  1e-138  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  44.44 
 
 
535 aa  494  1e-138  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0243  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  49.31 
 
 
542 aa  491  1e-138  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2121  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  49.12 
 
 
536 aa  492  1e-138  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443402  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3064  extracellular solute-binding protein  47.72 
 
 
542 aa  492  1e-138  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.150422 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3378  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  49.12 
 
 
542 aa  491  1e-138  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  47.22 
 
 
537 aa  493  1e-138  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3045  extracellular solute-binding protein  47.72 
 
 
542 aa  492  1e-138  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0437  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  49.31 
 
 
574 aa  491  1e-138  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217985  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3301  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  49.12 
 
 
542 aa  491  1e-138  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2431  extracellular solute-binding protein  47.72 
 
 
542 aa  492  1e-138  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2956  extracellular solute-binding protein  47.53 
 
 
542 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0220  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  48.48 
 
 
542 aa  491  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63568  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4234  extracellular solute-binding protein  48.55 
 
 
535 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0845  extracellular solute-binding protein  46.58 
 
 
532 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2915  extracellular solute-binding protein  45.79 
 
 
547 aa  485  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  44.44 
 
 
535 aa  488  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3090  extracellular solute-binding protein  47.34 
 
 
542 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4557  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  47.88 
 
 
535 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  46.78 
 
 
541 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6392  ABC oligopeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  47.72 
 
 
542 aa  485  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  45.35 
 
 
535 aa  484  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  46.46 
 
 
541 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0885  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  46.58 
 
 
541 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.575043  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  45.68 
 
 
530 aa  479  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  45.83 
 
 
541 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  45.3 
 
 
530 aa  478  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4559  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  45.11 
 
 
530 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>