More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6022 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  100 
 
 
321 aa  658    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2193  ferredoxin  63.47 
 
 
323 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0744529  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  56.52 
 
 
321 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  56.52 
 
 
321 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  56.52 
 
 
321 aa  361  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  56.52 
 
 
321 aa  361  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1385  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  56.21 
 
 
321 aa  359  3e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  56.21 
 
 
321 aa  358  7e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  56.21 
 
 
321 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  55.9 
 
 
321 aa  356  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  55.28 
 
 
321 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1620  ferredoxin  50 
 
 
321 aa  316  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1752  oxidoreductase  50.96 
 
 
316 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000180781 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1517  oxidoreductase  50 
 
 
321 aa  316  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  51.57 
 
 
317 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0441  ferredoxin  47.63 
 
 
317 aa  270  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.476743 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3313  ferredoxin  43.34 
 
 
321 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.77 
 
 
321 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6582  ferredoxin  42.41 
 
 
321 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71028  normal  0.0286768 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5962  ferredoxin  44.55 
 
 
318 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0118173 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0171  ferredoxin  45.28 
 
 
316 aa  256  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3181  ferredoxin  44.41 
 
 
318 aa  252  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0458671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3454  ferredoxin  45.25 
 
 
309 aa  250  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246796  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  42.94 
 
 
322 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3608  ferredoxin  41.49 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  42.62 
 
 
316 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3584  phthalate 4,5-dioxygenase  47.48 
 
 
318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  41.43 
 
 
322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  41.9 
 
 
323 aa  229  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  44.76 
 
 
322 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  41.31 
 
 
316 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  43.38 
 
 
319 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  42.67 
 
 
326 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  44.38 
 
 
351 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  41.31 
 
 
316 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  43.32 
 
 
321 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  42.16 
 
 
321 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  40.66 
 
 
316 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  40.33 
 
 
316 aa  222  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  42.16 
 
 
321 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  42.16 
 
 
321 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  42.72 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  43.18 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  41.41 
 
 
320 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  40.59 
 
 
317 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  38.05 
 
 
322 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  40.2 
 
 
323 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  41.18 
 
 
321 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  42.68 
 
 
325 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  43.27 
 
 
352 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  41.56 
 
 
317 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  42.63 
 
 
326 aa  215  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  39.34 
 
 
316 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  39.41 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  40.52 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  41.32 
 
 
330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  41.67 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5357  ferredoxin  42.31 
 
 
326 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  41.25 
 
 
317 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  41.56 
 
 
334 aa  212  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  39.31 
 
 
315 aa  210  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4624  ferredoxin  41.5 
 
 
322 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  39.09 
 
 
320 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  39.09 
 
 
320 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  41.46 
 
 
783 aa  209  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  42.41 
 
 
784 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  42.41 
 
 
784 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  42.41 
 
 
784 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  42.41 
 
 
784 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  42.77 
 
 
317 aa  208  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  42.09 
 
 
784 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  41.83 
 
 
320 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  42.09 
 
 
784 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  41.77 
 
 
784 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  40.39 
 
 
783 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  39.55 
 
 
319 aa  205  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  40.18 
 
 
321 aa  205  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0869  ferredoxin  36.96 
 
 
318 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  42.17 
 
 
326 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  41.61 
 
 
784 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  41.01 
 
 
327 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  39.8 
 
 
319 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  40.34 
 
 
588 aa  202  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  39.87 
 
 
320 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  39.94 
 
 
782 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  39.87 
 
 
788 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  42.57 
 
 
319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  39.22 
 
 
321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3213  ferredoxin  39.58 
 
 
344 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289084  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  39.09 
 
 
780 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4341  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  40.48 
 
 
313 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  39.26 
 
 
316 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2925  ferredoxin  40.13 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  40.2 
 
 
794 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  42.37 
 
 
319 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  40.13 
 
 
318 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  38.78 
 
 
321 aa  195  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  37.3 
 
 
315 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  39.53 
 
 
316 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4067  ferredoxin  36.88 
 
 
319 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>