More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0813 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0813  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 229 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.448575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  56.4 
 
 		 223 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0040  dethiobiotin synthase  46.48 
 
 		 215 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1867  dethiobiotin synthase  46.43 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0738  dethiobiotin synthase  45.93 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.232851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2876  dethiobiotin synthase  48.5 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5169  dethiobiotin synthase  43.87 
 
 		 225 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456743  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1345  dethiobiotin synthase  41.5 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.408659  normal  0.0545266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6356  dethiobiotin synthase  43.13 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2332  dethiobiotin synthase  41.94 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323651  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2287  dethiobiotin synthase  41.23 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2611  dethiobiotin synthase  41.15 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1110  dethiobiotin synthetase  41.32 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.588199  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0888  dethiobiotin synthase  41.57 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  35.61 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  33.82 
 
 		 212 aa  114  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  32.84 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  35.24 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  34.87 
 
 		 239 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1300  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  36.48 
 
 		 708 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0734897  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  30.94 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  34.53 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  33.63 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  29.67 
 
 		 646 aa  104  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  31.5 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  34.08 
 
 		 226 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  30.35 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  34 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  38.29 
 
 		 244 aa  99  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  32.65 
 
 		 230 aa  99  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  33.66 
 
 		 251 aa  98.6  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4031  dethiobiotin synthase  35.5 
 
 		 240 aa  98.6  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  33.66 
 
 		 262 aa  98.2  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  36.45 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  34.54 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  32.29 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  37.97 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  32.47 
 
 		 247 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  29.09 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  34.43 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  32.62 
 
 		 248 aa  95.1  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1437  dithiobiotin synthetase  33 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.581627 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  29.07 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  34.44 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  34.74 
 
 		 226 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  30.65 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  32.02 
 
 		 244 aa  92.4  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  28.82 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  28.82 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  28.51 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  31.68 
 
 		 220 aa  92  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  28.38 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  28.38 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  34.25 
 
 		 242 aa  90.9  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  28.51 
 
 		 225 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  27.95 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  32.64 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  28.38 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  32.02 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  34.63 
 
 		 210 aa  90.9  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  30.52 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  27.94 
 
 		 217 aa  90.9  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  33.01 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  31.03 
 
 		 234 aa  90.1  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  28.19 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0036  dethiobiotin synthase  32.51 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  31.03 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  28.93 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  28.36 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  36.41 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  33.16 
 
 		 249 aa  89.4  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  31.53 
 
 		 226 aa  89.4  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  31.03 
 
 		 238 aa  88.6  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  30.85 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  32.77 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  28.99 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2384  dethiobiotin synthase  30.77 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.393597  normal  0.141052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  30.35 
 
 		 266 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  31.03 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  28.57 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  32.03 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  30.15 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  29.57 
 
 		 239 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01810  dithiobiotin synthetase  29.76 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  31.84 
 
 		 242 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15911  putative dethiobiotin synthase  31.34 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.454357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  28.37 
 
 		 238 aa  85.9  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0249  dithiobiotin synthetase  28.76 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  30.54 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  34.07 
 
 		 243 aa  85.5  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  28.5 
 
 		 242 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  37.29 
 
 		 216 aa  85.5  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  31.37 
 
 		 230 aa  85.5  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  31.37 
 
 		 228 aa  85.5  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  28.23 
 
 		 242 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  29.05 
 
 		 242 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  27.94 
 
 		 242 aa  84.7  9e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  31.71 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0070  dethiobiotin synthase  38.54 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338425  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  28.64 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>