210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0060 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0060  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 301 aa  622  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.889116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0684  coproporphyrinogen III oxidase  66.56 
 
 		 307 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.092351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0647  coproporphyrinogen III oxidase  65.89 
 
 		 307 aa  408  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0673  coproporphyrinogen III oxidase  66.22 
 
 		 307 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3246  coproporphyrinogen III oxidase  62.67 
 
 		 295 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.630237  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2954  coproporphyrinogen III oxidase  65.44 
 
 		 315 aa  403  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3804  coproporphyrinogen III oxidase  65.55 
 
 		 298 aa  403  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154629 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1549  coproporphyrinogen III oxidase  65.67 
 
 		 303 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.252724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2169  coproporphyrinogen III oxidase  63.88 
 
 		 304 aa  398  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6063  coproporphyrinogen III oxidase  65.08 
 
 		 299 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.32246 
 
 
-
 
NC_004310  BR1550  coproporphyrinogen III oxidase  61.46 
 
 		 303 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.203239  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1616  coproporphyrinogen III oxidase  61.79 
 
 		 304 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1498  coproporphyrinogen III oxidase  60.8 
 
 		 303 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2786  coproporphyrinogen III oxidase  64.55 
 
 		 303 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.534406 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3050  coproporphyrinogen III oxidase  64.55 
 
 		 303 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4671  coproporphyrinogen III oxidase  63.39 
 
 		 310 aa  388  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2296  coproporphyrinogen III oxidase  65 
 
 		 295 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803269 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2621  coproporphyrinogen III oxidase  62.16 
 
 		 300 aa  376  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3221  coproporphyrinogen III oxidase  63.21 
 
 		 304 aa  374  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6599  coproporphyrinogen III oxidase  65.76 
 
 		 299 aa  368  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173551  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2240  coproporphyrinogen III oxidase  60.82 
 
 		 304 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0699  coproporphyrinogen III oxidase  58.92 
 
 		 290 aa  356  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0734  coproporphyrinogen III oxidase  56.7 
 
 		 318 aa  328  5.0000000000000004e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.518161 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0279  coproporphyrinogen III oxidase  54.7 
 
 		 300 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2944  coproporphyrinogen III oxidase  58.11 
 
 		 307 aa  325  5e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3764  coproporphyrinogen III oxidase  51.84 
 
 		 310 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323401  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2536  coproporphyrinogen III oxidase  51.54 
 
 		 287 aa  300  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1263  coproporphyrinogen III oxidase  51.7 
 
 		 304 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1701  coproporphyrinogen III oxidase  51.86 
 
 		 303 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4009  coproporphyrinogen III oxidase  50.5 
 
 		 303 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.586573  hitchhiker  0.00557292 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0454  coproporphyrinogen III oxidase  52.35 
 
 		 306 aa  291  7e-78  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1347  coproporphyrinogen III oxidase  54.03 
 
 		 286 aa  278  6e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.280799  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0674  coproporphyrinogen III oxidase  48.67 
 
 		 297 aa  273  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1398  coproporphyrinogen III oxidase  52.19 
 
 		 286 aa  267  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682731  normal  0.262285 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2337  coproporphyrinogen III oxidase  48.18 
 
 		 291 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0682  coproporphyrinogen III oxidase  47.85 
 
 		 291 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0548  coproporphyrinogen III oxidase  47.85 
 
 		 291 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3848  coproporphyrinogen III oxidase  46.49 
 
 		 292 aa  256  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0591  coproporphyrinogen III oxidase  43.83 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1752  coproporphyrinogen III oxidase  46.82 
 
 		 286 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_002978  WD1214  coproporphyrinogen III oxidase  45.63 
 
 		 256 aa  249  3e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2531  coproporphyrinogen III oxidase  45.51 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0446  coproporphyrinogen III oxidase  41.5 
 
 		 282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0752426  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2066  coproporphyrinogen III oxidase  45.78 
 
 		 310 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87254  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  43.79 
 
 		 303 aa  224  9e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  47.71 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1339  coproporphyrinogen III oxidase  45.95 
 
 		 306 aa  223  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0346  coproporphyrinogen III oxidase  46.08 
 
 		 302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1393  coproporphyrinogen III oxidase  43.92 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.586678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  40.87 
 
 		 347 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2784  coproporphyrinogen III oxidase  43.92 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390735 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3261  coproporphyrinogen III oxidase  44.48 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.77176  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1280  coproporphyrinogen III oxidase  43.58 
 
 		 309 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0135  coproporphyrinogen III oxidase  41.86 
 
 		 299 aa  219  6e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2591  coproporphyrinogen III oxidase  43.77 
 
 		 299 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4240  coproporphyrinogen III oxidase  42.91 
 
 		 323 aa  218  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1299  coproporphyrinogen III oxidase  44.81 
 
 		 307 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0514179 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2824  coproporphyrinogen III oxidase  44.75 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2620  Coproporphyrinogen oxidase  41.51 
 
 		 348 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2092  Coproporphyrinogen oxidase  42.23 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0593493  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  42.28 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1225  Coproporphyrinogen oxidase  44.11 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1243  coproporphyrinogen III oxidase  44.11 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4581  coproporphyrinogen III oxidase  42.64 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5623  coproporphyrinogen III oxidase  44.3 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2573  coproporphyrinogen III oxidase  44.11 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1900  coproporphyrinogen III oxidase  43.41 
 
 		 334 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.646946  normal  0.321427 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2279  Coproporphyrinogen oxidase  43.99 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.0202052 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  42.37 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1684  coproporphyrinogen III oxidase  43.97 
 
 		 323 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2296  coproporphyrinogen III oxidase  43.97 
 
 		 323 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643346  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  42.52 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02336  coproporphyrinogen III oxidase  43.77 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0674  coproporphyrinogen III oxidase  42.49 
 
 		 317 aa  216  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02298  hypothetical protein  43.77 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0982  coproporphyrinogen III oxidase  43.97 
 
 		 307 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2722  coproporphyrinogen III oxidase  43.77 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2334  coproporphyrinogen III oxidase  44.59 
 
 		 306 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193122  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2213  coproporphyrinogen III oxidase  44.59 
 
 		 306 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1193  Coproporphyrinogen oxidase  43.14 
 
 		 327 aa  215  7e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2319  coproporphyrinogen III oxidase  43.65 
 
 		 307 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.936275 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1441  coproporphyrinogen III oxidase  43.24 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.545118  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1705  coproporphyrinogen III oxidase  42.72 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0573078  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2687  coproporphyrinogen III oxidase  46.51 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.143173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2596  coproporphyrinogen III oxidase  46.9 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  42.03 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  42.03 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3211  Coproporphyrinogen oxidase  43.2 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2645  coproporphyrinogen III oxidase  46.9 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2817  coproporphyrinogen III oxidase  46.9 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56731  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  45.27 
 
 		 303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  42.03 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3669  coproporphyrinogen III oxidase  41.95 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  41.75 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1166  coproporphyrinogen III oxidase  41.19 
 
 		 343 aa  213  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235619 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1294  coproporphyrinogen III oxidase  45.26 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.770302 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2808  coproporphyrinogen III oxidase  43.43 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3290  Coproporphyrinogen oxidase  48.35 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3053  coproporphyrinogen III oxidase  40.57 
 
 		 344 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0025  coproporphyrinogen III oxidase  44.78 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>