More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_02010 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  100 
 
 
389 aa  766    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  42.08 
 
 
386 aa  276  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  41.76 
 
 
390 aa  272  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  41.3 
 
 
390 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  40.83 
 
 
382 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2797  glycosyl transferase group 1  45.36 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00591651  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  35.52 
 
 
414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  35.52 
 
 
414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  37.37 
 
 
399 aa  178  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  36.96 
 
 
372 aa  162  7e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  33.55 
 
 
904 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  31.99 
 
 
415 aa  133  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
390 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
398 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 
475 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
535 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 
389 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  26.71 
 
 
394 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1489  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
395 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113053  normal  0.618426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  32.18 
 
 
404 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
362 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 
367 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  31.72 
 
 
723 aa  98.6  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  26.62 
 
 
416 aa  97.1  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  32.82 
 
 
443 aa  96.3  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 
370 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 
416 aa  95.1  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  36.62 
 
 
800 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  33.19 
 
 
353 aa  93.2  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
412 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2102  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
388 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 
386 aa  91.3  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.76 
 
 
388 aa  91.7  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
360 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  36.16 
 
 
376 aa  90.9  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0777  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 
384 aa  90.9  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.135676  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  37.43 
 
 
377 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 
397 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 
409 aa  89.7  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 
356 aa  89  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  36.06 
 
 
404 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  34.57 
 
 
398 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 
373 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
417 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
457 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  37.24 
 
 
452 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
378 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 
417 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 
405 aa  87.4  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 
405 aa  87.4  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.41 
 
 
401 aa  86.7  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 
445 aa  86.7  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
409 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  41.21 
 
 
381 aa  86.7  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  34.24 
 
 
374 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4436  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 
377 aa  86.3  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
402 aa  86.3  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
414 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
407 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  34.43 
 
 
452 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 
411 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 
384 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 
482 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.87 
 
 
407 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.5 
 
 
409 aa  84.3  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
406 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6400  glycosyl transferase group 1  41.88 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
412 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  34.55 
 
 
421 aa  84  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  37.71 
 
 
739 aa  83.6  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  36.68 
 
 
399 aa  83.2  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  34.23 
 
 
395 aa  82.8  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
410 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
412 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 
467 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 
405 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.64 
 
 
375 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
434 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 
393 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
378 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 
388 aa  81.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.86 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  35.09 
 
 
407 aa  82  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2072  group 1 glycosyl transferase  27.49 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  29.96 
 
 
564 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  35.26 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>