118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2305 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2305  CheW protein  100 
 
 
235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4573  CheW protein  88.94 
 
 
233 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468736  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3790  CheW protein  88.94 
 
 
233 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3734  CheW protein  88.94 
 
 
233 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5516  CheW protein  84.32 
 
 
240 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334912  normal  0.661174 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3682  CheW protein  84.52 
 
 
238 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358535  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4943  CheW protein  80.16 
 
 
247 aa  351  7e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318865  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0504  chemotaxis protein cheW  60.42 
 
 
239 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369633  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1401  chemotaxis protein cheW  57.72 
 
 
244 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1598  chemotaxis protein cheW  57.72 
 
 
244 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2539  CheW domain-containing protein  57.72 
 
 
244 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155706  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0257  chemotaxis protein cheW  57.72 
 
 
244 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2684  CheW domain-containing protein  57.26 
 
 
246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5392  CheW protein  50.22 
 
 
233 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0220  chemotaxis protein cheW  57.64 
 
 
201 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.981977  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0965  chemotaxis protein cheW  57.64 
 
 
201 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3976  CheW protein  45.78 
 
 
226 aa  185  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16460  CheW domain-containing protein  41.05 
 
 
229 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1096  CheW protein  39.24 
 
 
221 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.153582  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4231  putative CheW protein  38.98 
 
 
221 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1491  CheW domain-containing protein  39.21 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000195231  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1432  hypothetical protein  38.57 
 
 
229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3970  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  39.66 
 
 
250 aa  145  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000212039  hitchhiker  0.0041707 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4127  CheW protein  38.64 
 
 
221 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0808304  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3650  CheW protein  38.22 
 
 
225 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107896  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1524  CheW protein  30.04 
 
 
246 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1306  CheW-like protein  39.11 
 
 
229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2056  CheW protein  30 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2030  CheW protein  30 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1496  CheW domain protein  38.67 
 
 
229 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1055  CheW protein  38.46 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0830  CheW-like domain-containing protein  32.89 
 
 
217 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  29.45 
 
 
158 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  28.95 
 
 
152 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  28.95 
 
 
152 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  26.62 
 
 
151 aa  52.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.5 
 
 
164 aa  52.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  26.62 
 
 
148 aa  52.8  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  27.66 
 
 
163 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  27.4 
 
 
140 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  24.29 
 
 
302 aa  50.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000715462  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  23.94 
 
 
141 aa  50.1  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  24.29 
 
 
302 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  24.29 
 
 
302 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  26.62 
 
 
155 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  23.81 
 
 
163 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  24.29 
 
 
302 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  24.29 
 
 
302 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  24.29 
 
 
302 aa  48.9  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  26.09 
 
 
155 aa  48.9  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  26.62 
 
 
155 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  29.25 
 
 
163 aa  48.5  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  23.57 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  23.57 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  26.87 
 
 
149 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0927  CheW protein  24.36 
 
 
157 aa  48.1  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  27.59 
 
 
165 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  23.57 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  27.59 
 
 
165 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  23.29 
 
 
156 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  27.21 
 
 
164 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  28.57 
 
 
139 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  28.36 
 
 
152 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  25.83 
 
 
159 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  27.89 
 
 
167 aa  47.4  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  23.29 
 
 
156 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  33.33 
 
 
169 aa  46.6  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  28.48 
 
 
187 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4454  CheW protein  40.98 
 
 
137 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4473  CheW protein  40.98 
 
 
137 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  25.9 
 
 
139 aa  46.6  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  27.27 
 
 
262 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  23.02 
 
 
154 aa  45.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  26.67 
 
 
165 aa  45.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4318  CheW protein  42.11 
 
 
137 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.450295  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  26.67 
 
 
165 aa  45.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  24.14 
 
 
178 aa  45.4  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  28.66 
 
 
169 aa  45.4  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0258  CheW protein  24.48 
 
 
152 aa  45.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000534163  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  23.02 
 
 
154 aa  45.4  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2361  CheW protein  31.4 
 
 
342 aa  45.4  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  26.57 
 
 
163 aa  45.4  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  26.9 
 
 
165 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  26 
 
 
189 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  26.67 
 
 
164 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  23.49 
 
 
167 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  23.02 
 
 
158 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  27.34 
 
 
157 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  26.43 
 
 
162 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  24.46 
 
 
159 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  24.82 
 
 
163 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  28.08 
 
 
155 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  26.17 
 
 
146 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  23.74 
 
 
158 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  26.24 
 
 
164 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  32.03 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  24.84 
 
 
162 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4463  putative CheW protein  37.7 
 
 
137 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0241255  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  27.56 
 
 
306 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  26.9 
 
 
168 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>