More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6170 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
336 aa  643    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.353707  normal  0.0409254 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  99.4 
 
 
336 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  99.4 
 
 
336 aa  641    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7203  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  73.75 
 
 
348 aa  435  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0566155  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1600  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  56.55 
 
 
313 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2383  dipeptide ABC transporter  56.49 
 
 
323 aa  292  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.25 
 
 
319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.86 
 
 
316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112233  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.84 
 
 
330 aa  247  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.6 
 
 
319 aa  246  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.923467  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.13 
 
 
340 aa  238  9e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112325  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3604  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.7 
 
 
321 aa  235  8e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.71 
 
 
321 aa  231  9e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.03 
 
 
321 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.166437  normal  0.409342 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.18 
 
 
332 aa  223  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.191743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.3 
 
 
315 aa  217  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2531  ABC transporter permease  37.07 
 
 
330 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.41 
 
 
345 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0940  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.49 
 
 
338 aa  203  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0444198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.77 
 
 
328 aa  202  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00770957  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2959  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.85 
 
 
316 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.8 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.544656  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 
313 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3089  nickel ABC transporter, permease protein  40.2 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175953  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
319 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3222  ABC transporter, permease protein  40.78 
 
 
316 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
313 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34320  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.29 
 
 
316 aa  193  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
312 aa  192  9e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
314 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.38 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
329 aa  189  7e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.46 
 
 
313 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5088  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  38.26 
 
 
313 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18680  ABC transporter, inner membrane permease component  41.06 
 
 
318 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158207  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.48 
 
 
313 aa  185  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.44 
 
 
313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2031  ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.381274  normal  0.768388 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0350  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  34.52 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5121  putative ABC transporter permease protein  37.24 
 
 
298 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.407731 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 
313 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.07 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0364256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  37.1 
 
 
313 aa  182  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 
313 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.48 
 
 
314 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.965219  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
305 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.143195 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.4 
 
 
309 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
306 aa  179  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
308 aa  179  8e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2575  peptide ABC transporter, permease protein  36.91 
 
 
305 aa  178  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38 
 
 
314 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
356 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 
313 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3533  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  37.28 
 
 
305 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
316 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3654  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
304 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276261  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
338 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  36.83 
 
 
336 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 
311 aa  177  3e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  36.21 
 
 
313 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
336 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
309 aa  176  5e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4175  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
314 aa  176  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  36.51 
 
 
336 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24430  Binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 
338 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.276655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
306 aa  176  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
307 aa  176  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.089816 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2266  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.58 
 
 
305 aa  175  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0437136  normal  0.510815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 
317 aa  175  9e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.650589  normal  0.092891 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
314 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.935308  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  36.19 
 
 
336 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1299  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.01 
 
 
307 aa  175  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  36.83 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  36.19 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  36.19 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109225  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12210  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  39.8 
 
 
330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  35 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 
323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181861  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
305 aa  173  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
316 aa  172  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
306 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  35.56 
 
 
336 aa  172  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
313 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
324 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  34.97 
 
 
306 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  34.97 
 
 
306 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
327 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  34.97 
 
 
306 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
313 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 
320 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0617346  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
305 aa  170  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.507532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>