More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2632 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05872  ClpA/B type protease  52.5 
 
 		 894 aa  700    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2627  ATPase  62.83 
 
 		 865 aa  824    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0459  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.16 
 
 		 884 aa  709    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0433  clpB protein, putative  55.51 
 
 		 875 aa  659    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4084  type VI secretion ATPase  56.94 
 
 		 916 aa  725    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000202411 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2954  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.31 
 
 		 888 aa  714    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.400792  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3095  chaperone-associated ATPase, putative  62.83 
 
 		 878 aa  825    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_003296  RS01959  putative CLPA/B-type chaperone protein  77.16 
 
 		 905 aa  1047    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3118  ATPase  58.09 
 
 		 889 aa  739    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0362166 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1177  chaperone ClpB-1  50.37 
 
 		 872 aa  665    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2548  clpB protein, putative  49.56 
 
 		 867 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5425  clpB protein, putative  51.57 
 
 		 882 aa  672    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2829  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.31 
 
 		 888 aa  714    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2830  ClpA/B type protease  89.87 
 
 		 897 aa  1189    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0409  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.16 
 
 		 884 aa  709    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0942  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  53.51 
 
 		 906 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2890  type VI secretion ATPase  56.58 
 
 		 849 aa  682    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2505  type VI secretion ATPase  63.86 
 
 		 865 aa  851    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4958  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  63.38 
 
 		 867 aa  843    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2331  ATPase  57.16 
 
 		 900 aa  741    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518917  normal  0.0250901 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2171  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  77.6 
 
 		 899 aa  1042    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2366  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  57.5 
 
 		 904 aa  727    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266382 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  58.37 
 
 		 898 aa  758    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141687  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1684  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  55.43 
 
 		 898 aa  688    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0451  type VI secretion ATPase  99.71 
 
 		 889 aa  1367    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1789  ATPase  52.1 
 
 		 884 aa  665    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3638  protease associated ATPase ClpB  90.01 
 
 		 889 aa  1193    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1194  SciG protein  58.31 
 
 		 888 aa  717    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445857  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4919  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  88.69 
 
 		 891 aa  1191    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.989717  hitchhiker  0.00768481 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3412  ClpA/B-type protease  56.3 
 
 		 846 aa  683    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.219119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2505  AAA family ATPase  52.38 
 
 		 880 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5584  ClpB protein, putative  51.28 
 
 		 885 aa  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3474  hypothetical protein  57.8 
 
 		 889 aa  714    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2820  heat shock protein ClpB-like  52.68 
 
 		 899 aa  654    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3565  chaperonin clpA/B/, ATPase  97.65 
 
 		 889 aa  1318    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0979  AAA ATPase, Clp  54.64 
 
 		 893 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1582  AAA ATPase, Clp  57.82 
 
 		 887 aa  700    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00259  ClpB  56.9 
 
 		 901 aa  730    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388989  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2982  AAA family ATPase  51.15 
 
 		 880 aa  636    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00017738 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3315  AAA ATPase  55.28 
 
 		 878 aa  645    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02051  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  75.97 
 
 		 910 aa  1007    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0408  type VI secretion ATPase  97.8 
 
 		 889 aa  1295    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000027  ClpB protein  53.12 
 
 		 855 aa  657    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0140  ClpA/B type protease  53.86 
 
 		 918 aa  638    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0264  ClpA/B type protease  58.16 
 
 		 885 aa  718    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2449  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  58.15 
 
 		 869 aa  712    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258414  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2958  ClpA/B type protease  90.16 
 
 		 887 aa  1195    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3013  ATPase  58.61 
 
 		 887 aa  707    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50860  AAA ATPase  55.81 
 
 		 842 aa  674    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1536  fibronectin, type III  55.15 
 
 		 897 aa  723    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0530  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  55.92 
 
 		 909 aa  740    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2096  putative ClpA/B-type chaperone, ATPase subunit ClpB, heat shock protein  53.85 
 
 		 916 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3036  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  55.77 
 
 		 903 aa  704    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125208  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2273  ATPase AAA-2  63 
 
 		 889 aa  845    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1474  type VI secretion ATPase  54.42 
 
 		 885 aa  672    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0618  ATPase AAA-2  50.9 
 
 		 893 aa  636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0224161 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000450  ClpB protein  52.18 
 
 		 687 aa  682    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3864  type VI secretion ATPase  58.02 
 
 		 928 aa  707    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2924  type VI secretion ATPase  96.04 
 
 		 889 aa  1296    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2632  ATPase AAA-2  100 
 
 		 681 aa  1368    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1362  Clp protease-associated protein ClpB  54.42 
 
 		 885 aa  672    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26610  ClpA/B-type protease  59.36 
 
 		 886 aa  728    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3147  ClpA/B type protease  89.87 
 
 		 889 aa  1188    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2362  ATPase  54.26 
 
 		 868 aa  714    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488644  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0162  type VI secretion ATPase  57.76 
 
 		 902 aa  769    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.475088  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0387  ATPase  97.8 
 
 		 889 aa  1296    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315602  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3473  ATPase  56.44 
 
 		 897 aa  667    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.150348  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01100  putative ClpA/B-type chaperone  58.06 
 
 		 902 aa  773    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33990  putative ClpA/B-type protease  56.19 
 
 		 849 aa  677    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000016123  normal  0.0826946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42980  putative ClpA/B-type protease  51.79 
 
 		 877 aa  669    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172523  normal  0.0852173 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0097  ATPase  51.66 
 
 		 866 aa  635    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3906  type VI secretion ATPase  55.39 
 
 		 893 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.356382 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0473  ATPase  99.85 
 
 		 889 aa  1368    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2440  ATPase  56.23 
 
 		 915 aa  692    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217736  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2696  Clp ATPase  53.96 
 
 		 891 aa  666    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310032  hitchhiker  0.00716242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3610  type VI secretion ATPase  51.42 
 
 		 875 aa  663    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3654  ClpA/B type protease  89.87 
 
 		 889 aa  1188    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3629  ClpA/B type protease  90.16 
 
 		 889 aa  1195    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2769  type VI secretion ATPase  64.16 
 
 		 865 aa  845    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186875  normal  0.804579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0200  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  57.31 
 
 		 908 aa  706    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5984  type VI secretion ATPase  59.04 
 
 		 909 aa  752    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1606  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.16 
 
 		 884 aa  709    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0054  ClpA/B type protease  89.87 
 
 		 897 aa  1189    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3069  ATPase  62.06 
 
 		 882 aa  799    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1789  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.16 
 
 		 884 aa  709    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160275  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1713  ClpA/B type protease  89.87 
 
 		 889 aa  1188    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3129  ClpA/ClpB family protein  51.71 
 
 		 881 aa  634  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5260  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:phosphopantetheine attachment site  50.44 
 
 		 913 aa  633  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1625  SciG protein  53.3 
 
 		 918 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398172  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0804  type VI secretion ATPase  52.23 
 
 		 880 aa  634  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6693  type VI secretion ATPase  54.11 
 
 		 889 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0732  type VI secretion ATPase  51.46 
 
 		 882 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.759249  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0156  chaperone clpB  53.89 
 
 		 895 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6115  type VI secretion ATPase  53.44 
 
 		 906 aa  632  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24944 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3246  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  50.44 
 
 		 865 aa  629  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0178  chaperone clpB  53.59 
 
 		 895 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3008  type VI secretion ATPase  53.99 
 
 		 887 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0170  AAA family ATPase  51.17 
 
 		 882 aa  630  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000964396 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3724  ATPase  49.86 
 
 		 895 aa  631  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1079  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  50.29 
 
 		 865 aa  625  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0505801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>