102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2347 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 328 aa  623  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  63.49 
 
 		 313 aa  301  9e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1666  cytochrome oxidase assembly  59.75 
 
 		 348 aa  288  7e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00799414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  55.52 
 
 		 320 aa  261  8e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  51.36 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  51.82 
 
 		 307 aa  219  6e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  43.84 
 
 		 351 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  41.61 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  44.41 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  42.04 
 
 		 342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  43.1 
 
 		 322 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  41.21 
 
 		 337 aa  177  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  43.69 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2217  cytochrome oxidase assembly  45.1 
 
 		 351 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000899528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  43.69 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  43.97 
 
 		 325 aa  172  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  44.92 
 
 		 305 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  41.72 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1995  putative integral membrane transport protein  42.76 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  43.57 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  40.44 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3085  cytochrome oxidase assembly  43.45 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734948  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2971  cytochrome oxidase assembly  40.21 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  39.51 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  39.73 
 
 		 386 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  40.53 
 
 		 338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  40.32 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2553  cytochrome oxidase assembly  40.83 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  41.23 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  36.23 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  39.46 
 
 		 370 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3684  cytochrome oxidase assembly  39.94 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2429  cytochrome oxidase assembly  40.51 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2474  cytochrome oxidase assembly  40.51 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2467  cytochrome oxidase assembly  38.38 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2726  cytochrome oxidase assembly  37.14 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  36.62 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11484  antibiotic ABC transporter membrane protein  38.58 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.802636 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  39.16 
 
 		 298 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  31.17 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0409  cytochrome oxidase assembly  31.56 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  32.47 
 
 		 622 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  25.31 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  33.97 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  32.59 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  32.59 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  32.59 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  32.59 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  32.59 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  32.59 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  32.59 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  32.59 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  32.59 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  27.18 
 
 		 404 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  29.41 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  25 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  30.41 
 
 		 327 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  26.57 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  30.07 
 
 		 363 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  29.37 
 
 		 396 aa  52.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  30.07 
 
 		 363 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  34.57 
 
 		 356 aa  52.8  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  32.03 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  29.37 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  29.1 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0636  cytochrome oxidase assembly  31.36 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  27.57 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  28.79 
 
 		 325 aa  50.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  27.87 
 
 		 339 aa  49.7  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  32.82 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  34.65 
 
 		 345 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  30.95 
 
 		 411 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  30.6 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  32.04 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  31.06 
 
 		 361 aa  47  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  28.99 
 
 		 319 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  33.59 
 
 		 359 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  26.51 
 
 		 308 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  27 
 
 		 318 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  27.5 
 
 		 337 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  28.49 
 
 		 304 aa  46.2  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  28.03 
 
 		 326 aa  46.2  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  22.12 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  29.77 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  26.51 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  31.34 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  29.17 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  27.55 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  27.27 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  30.37 
 
 		 383 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  24.09 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  27.07 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  37.68 
 
 		 354 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  27.41 
 
 		 367 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  36.59 
 
 		 343 aa  43.5  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  27.27 
 
 		 325 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  26.43 
 
 		 286 aa  43.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  32.79 
 
 		 359 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  27.27 
 
 		 325 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  27.27 
 
 		 325 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>