226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1899 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  100 
 
 
438 aa  865    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  45.94 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  50.46 
 
 
447 aa  385  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  49.88 
 
 
425 aa  388  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  46.85 
 
 
441 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  49.07 
 
 
437 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  48.95 
 
 
437 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  46.99 
 
 
433 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  50 
 
 
475 aa  372  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  46.65 
 
 
452 aa  368  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  46.51 
 
 
435 aa  364  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  46.79 
 
 
473 aa  363  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  47.1 
 
 
445 aa  363  4e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  46.82 
 
 
486 aa  361  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  45.87 
 
 
439 aa  360  3e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  47.2 
 
 
432 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  45.33 
 
 
427 aa  351  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  44.21 
 
 
437 aa  341  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  44.12 
 
 
438 aa  339  7e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  44.03 
 
 
436 aa  331  1e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  36.26 
 
 
437 aa  307  3e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  40.56 
 
 
428 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  35.35 
 
 
434 aa  300  5e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  34.88 
 
 
438 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  35.12 
 
 
437 aa  292  7e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  35.12 
 
 
437 aa  292  8e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  34.42 
 
 
437 aa  292  8e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  34.88 
 
 
437 aa  292  8e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  41.49 
 
 
470 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  34.88 
 
 
437 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  34.88 
 
 
437 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  34.88 
 
 
437 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  34.88 
 
 
437 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  35.66 
 
 
460 aa  253  6e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  34.91 
 
 
440 aa  243  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  33.41 
 
 
429 aa  239  8e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  33.64 
 
 
417 aa  238  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  33.64 
 
 
464 aa  237  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  34.71 
 
 
424 aa  236  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  34.57 
 
 
464 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  34.19 
 
 
442 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  32.48 
 
 
469 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.94 
 
 
409 aa  221  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.11 
 
 
445 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  31.24 
 
 
423 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  32.02 
 
 
411 aa  210  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  30.07 
 
 
412 aa  206  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  30.84 
 
 
439 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  30.44 
 
 
415 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  30.75 
 
 
415 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  31.15 
 
 
415 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  29.95 
 
 
478 aa  187  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  33.1 
 
 
466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  30.96 
 
 
418 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  30.54 
 
 
418 aa  140  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  32.79 
 
 
421 aa  139  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  27.29 
 
 
574 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.75 
 
 
417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  29.4 
 
 
437 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  34.18 
 
 
246 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  31.24 
 
 
424 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.95 
 
 
449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.5 
 
 
462 aa  130  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  28.8 
 
 
427 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  30.18 
 
 
423 aa  120  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  24.18 
 
 
556 aa  119  7.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  28.97 
 
 
430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  27.03 
 
 
421 aa  110  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  26.33 
 
 
448 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  30.99 
 
 
572 aa  103  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  27.78 
 
 
483 aa  99.8  9e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  26.56 
 
 
446 aa  99  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  38.73 
 
 
429 aa  92.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.35 
 
 
504 aa  87.4  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  22.65 
 
 
642 aa  84.7  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  18.66 
 
 
478 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  18.44 
 
 
478 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  19.52 
 
 
468 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  19.34 
 
 
471 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  23.56 
 
 
478 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  23.56 
 
 
478 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.43 
 
 
490 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  24.45 
 
 
453 aa  75.5  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  23.28 
 
 
475 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  23.08 
 
 
478 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  23.08 
 
 
471 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  21.96 
 
 
478 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  26.85 
 
 
444 aa  72.4  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  29.23 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  34.83 
 
 
452 aa  70.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.98 
 
 
462 aa  70.1  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  29.28 
 
 
413 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.81 
 
 
463 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  23.31 
 
 
476 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  39.76 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.83 
 
 
454 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  23.81 
 
 
481 aa  67  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1468  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.25 
 
 
484 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  23.97 
 
 
461 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 
445 aa  63.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>