More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1452 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1452  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 328 aa  656    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1473  oxidoreductase domain-containing protein  99.39 
 
 		 328 aa  654    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  91.77 
 
 		 328 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  91.16 
 
 		 328 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  91.77 
 
 		 328 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  91.77 
 
 		 328 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1681  oxidoreductase domain-containing protein  90.85 
 
 		 328 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0855152 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1258  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  80.31 
 
 		 327 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.185464  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1975  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  80.31 
 
 		 327 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1741  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  80.31 
 
 		 327 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.994489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0151  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  80.31 
 
 		 327 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.191769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1822  oxidoreductase, NAD-binding  80.31 
 
 		 327 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1015  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  80.31 
 
 		 327 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1806  oxidoreductase, NAD-binding  80 
 
 		 327 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.677561  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2514  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  80.62 
 
 		 327 aa  478  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0152325  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  71.56 
 
 		 348 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  70.94 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  70.31 
 
 		 334 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  35.15 
 
 		 327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  36.56 
 
 		 329 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  34.15 
 
 		 328 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  36.42 
 
 		 329 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  36.73 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  34.03 
 
 		 354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  32.52 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  34.05 
 
 		 329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 		 329 aa  149  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  34.88 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  32.11 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  36.67 
 
 		 379 aa  142  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  31.89 
 
 		 321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  30.54 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  29.87 
 
 		 321 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  35.47 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  34.55 
 
 		 352 aa  137  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  32.67 
 
 		 319 aa  136  5e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  34.33 
 
 		 336 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  34.27 
 
 		 334 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  33.14 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  32.82 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  29.36 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  32.56 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  36.11 
 
 		 338 aa  133  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  31.73 
 
 		 362 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  33.54 
 
 		 342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  30.03 
 
 		 328 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  28.75 
 
 		 323 aa  132  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26160  predicted dehydrogenase  34.88 
 
 		 358 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0688077  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  26.56 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  31.63 
 
 		 346 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  31.83 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  34.21 
 
 		 358 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  36.94 
 
 		 354 aa  126  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  35.2 
 
 		 338 aa  126  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  35.44 
 
 		 341 aa  125  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2588  cytidyltransferase-related domain protein  33.02 
 
 		 447 aa  124  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  33.13 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  32.23 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 		 667 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 		 338 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  29.71 
 
 		 667 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  35.09 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 		 667 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  33.98 
 
 		 665 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  32.13 
 
 		 357 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1210  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  28.27 
 
 		 331 aa  115  8.999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  26.61 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  29.54 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  30.12 
 
 		 667 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  31.18 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  28.62 
 
 		 451 aa  114  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  35.11 
 
 		 360 aa  113  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  33.03 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  33.99 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  27.25 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.31 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  29.81 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.53 
 
 		 349 aa  106  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  34.1 
 
 		 670 aa  105  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  23.34 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.22 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  27.85 
 
 		 388 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  26.63 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.32 
 
 		 338 aa  102  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  28.3 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  27.99 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1333  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 665 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  31.04 
 
 		 338 aa  96.3  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.6 
 
 		 319 aa  95.9  8e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  33.77 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05910  cytidyltransferase-related enzyme  27.34 
 
 		 464 aa  94.7  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  36.55 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  29.04 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25422  predicted protein  24.72 
 
 		 374 aa  92.8  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3183  oxidoreductase domain-containing protein  33.56 
 
 		 305 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  25.93 
 
 		 361 aa  90.1  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 		 331 aa  89.7  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.26 
 
 		 329 aa  89.7  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>