More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6177 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6177  CBS domain-containing protein  100 
 
 
149 aa  291  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5931  CBS domain-containing protein  89.26 
 
 
149 aa  230  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  52.7 
 
 
149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  52.7 
 
 
149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  52.7 
 
 
149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  52.7 
 
 
149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  52.7 
 
 
149 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  53.38 
 
 
149 aa  159  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  52 
 
 
150 aa  157  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  52.03 
 
 
291 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  52.03 
 
 
211 aa  156  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  50.67 
 
 
150 aa  153  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  40.94 
 
 
149 aa  116  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  41.89 
 
 
150 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0248  putative signal transduction protein with CBS domains  39.86 
 
 
149 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  45.69 
 
 
149 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  36.49 
 
 
162 aa  99.4  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  44.72 
 
 
153 aa  98.2  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  35.81 
 
 
149 aa  97.4  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  44.72 
 
 
153 aa  94.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  39.66 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0067  putative inosine monophosphate dehydrogenase  36.11 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5203  CBS domain containing protein  35.11 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  38.26 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  34.97 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  42.74 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  41.23 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  38.1 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  35.25 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  34.27 
 
 
154 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.48 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  34.96 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  40 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  33.63 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  34.71 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  36.8 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  39.34 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.44 
 
 
478 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  34.4 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  34.15 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  32.79 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  31.36 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  34.96 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  34.21 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3235  hypothetical protein  32.38 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  38.46 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.46 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  38.66 
 
 
480 aa  63.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  39.02 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  39.82 
 
 
141 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  32.52 
 
 
207 aa  62.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  37.29 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  33.33 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  35.65 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  37.61 
 
 
187 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0764  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 
605 aa  62  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0514021 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  40.17 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  39.32 
 
 
170 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  39.5 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  39.5 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  34.96 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  34.96 
 
 
204 aa  61.6  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.82 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  30.08 
 
 
139 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  39.5 
 
 
141 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  33.33 
 
 
242 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  34.11 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  36.44 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  26.23 
 
 
165 aa  60.1  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  36.44 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  34.15 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  30.89 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  38.66 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  35.04 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  40.91 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  34.15 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  42.31 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  41.35 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  40 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  35.77 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3147  hypothetical protein  36.89 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643619  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  31.97 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  31.45 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  34.88 
 
 
142 aa  58.2  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  30.65 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4731  CBS domain-containing protein  32.58 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  35.59 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  35.59 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2130  CBS domain containing protein  32.8 
 
 
208 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418826 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  34.19 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  27.27 
 
 
188 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  35.04 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 
1344 aa  57.4  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  31.5 
 
 
203 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  39.67 
 
 
141 aa  57  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  34.96 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  36.52 
 
 
141 aa  57  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  24.43 
 
 
189 aa  57  0.00000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>